البيانات المكانية ناباري
0.5.3
يحتوي هذا المستودع على مكون إضافي napari لاستكشاف كائنات SpatialData والتعليق عليها بشكل تفاعلي. هنا يمكنك العثور على وثائق البيانات المكانية napari. تعد napari-spatialdata جزءًا من النظام البيئي SpatialData . لمعرفة المزيد حول البيانات المكانية، يرجى مراجعة وثائق البيانات المكانية.
يمكنك تثبيت napari-spatialdata عبر النقطة:
pip install napari-spatialdata[all]
سيقوم الأمر all بتثبيت روابط qt PyQt5 .
يمكنك العثور على مزيد من التفاصيل حول هذا الأمر في تعليمات التثبيت.
إذا كنت ترغب في استخدام البرنامج المساعد باعتباره قارئ zarr الافتراضي، في napari، يرجى الانتقال إلى File -> Preferences -> Plugins واتباع الإرشادات الموجودة ضمن File extension readers .
يمكنك تثبيت napari-spatialdata من Github باستخدام:
pip install git+https://github.com/scverse/napari-spatialdata
أو يمكنك أيضًا التثبيت في الوضع القابل للتحرير بعد استنساخ الريبو عن طريق:
git clone https://github.com/scverse/napari-spatialdatacd napari-spatialdatapip install -e .
ملاحظة: عند إجراء تثبيت قابل للتحرير لـ napari-spatialdata ، ستتم إعادة تثبيت spatialdata من pip . لذلك، إذا قمت سابقًا أيضًا بإجراء تثبيت قابل للتحرير spatialdata ، فستحتاج إلى إعادة تشغيل pip install -e . في مستودع spatialdata . يرجى العثور على مزيد من التفاصيل حول هذا في تعليمات التثبيت.
لمعرفة كيفية استخدام البرنامج المساعد napari-spatialdata ، يرجى الاطلاع على الوثائق. لمعرفة كيفية دمج البيانات المكانية napari في سير عمل التحليل، يرجى الاطلاع على البرامج التعليمية للبيانات المكانية. بخاصة:
شرح المناطق ذات الاهتمام باستخدام napari
استخدم التعليقات التوضيحية المميزة لمحاذاة طبقات omics المتعددة
المساهمات هي موضع ترحيب كبير. يمكن إجراء الاختبارات باستخدام السموم، يرجى التأكد من بقاء التغطية كما هي على الأقل قبل إرسال طلب السحب.
يتم توزيع "napari-spatialdata" بموجب شروط ترخيص BSD-3، وهو برنامج مجاني ومفتوح المصدر.
إذا واجهت أي مشاكل، يرجى تقديم مشكلة مع وصف تفصيلي.
ماركوناتو، L.، بالا، G.، ياموتشي، كا وآخرون. البيانات المكانية: إطار بيانات مفتوح وعالمي للتحليلات المكانية. طرق نات (2024). https://doi.org/10.1038/s41592-024-02212-x
