Opal

Opal

Opal ist die zentrale Datenbankanwendung von OBiBa für Biobanken oder epidemiologische Studien.

• Siehe Download-Anweisungen.
• Lesen Sie die Dokumentation.
• Haben Sie einen Fehler oder eine Frage? Bitte erstellen Sie ein Problem auf GitHub.
• Kontinuierliche Integration liegt bei Travis.

Entwickler

Richten Sie eine Entwicklungsumgebung ein:

• Stellen Sie sicher, dass Java8 verfügbar ist.
• Stellen Sie sicher, dass eine MongoDB-, MySQL- oder MariaDB-Datenbank ausgeführt wird.
• Kompilieren Sie mit make all
• Holen Sie sich das Obiba-Home-Repository, um etwas Saatgut zu haben.
• Ausführungsumgebung vorbereiten: make prepare (nur einmal ausführen, dadurch wird ein opal_home-Verzeichnis erstellt)
• Im Debug-Modus ausführen: make debug
• Melden Sie sich unter http://localhost:8080 mit Administrator-/Passwort-Anmeldeinformationen an.
• Deklarieren Sie die Datenbanken (nur bei der ersten Verbindung)
• Gehen Sie zum Obiba-Home- Projekt und make seed-opal

Es gibt viele andere Ziele. Überprüfen Sie einfach das Makefile und ändern Sie die Variablen entsprechend Ihrer Umgebung.

Mailingliste

Haben Sie eine Frage? Fragen Sie auf unserer Mailingliste!

[email protected]

http://groups.google.com/group/obiba-users

Lizenz

OBiBa-Software ist Open Source und wird unter der GPL3-Lizenz zur Verfügung gestellt. Die OBiBa-Software ist kostenlos.

OBiBa-Danksagungen

Wenn Sie OBiBa-Software verwenden, zitieren Sie unsere Arbeit bitte in Ihrem Code, Ihren Websites, Veröffentlichungen oder Berichten.

„Die hier vorgestellte Arbeit wurde durch die OBiBa-Suite (www.obiba.org) ermöglicht, eine von Maelstrom Research (www.maelstrom-research.org) und Epigeny (www.epigeny.io) entwickelte Software-Suite.“