SDA-Download

Archivhinweis

️ Dieses Repository wird nicht mehr gepflegt. Der Code wurde integriert und wird weiterentwickelt unter: https://github.com/neicnordic/sensitive-data-archive

SDA-Download

sda-download ist eine go -Implementierung der Data Out API. Die API-Referenz enthält Beispielanfragen und -antworten.

Einsatz

Die empfohlene Bereitstellungsmethode für die Produktion ist:

• auf einem kubernetes cluster mit dem Helm-Chart;

Für lokale Entwicklung/Tests siehe Anweisungen im Ordner dev_utils. Im Ordner dev_utils befindet sich eine README-Datei mit Abschnitten zum lokalen Ausführen der Pipeline mithilfe von Docker Compose.

• Erster Lauf
• Produktion wie im Lauf
• Manuelle Ausführung

API-Komponenten

Komponente	Rolle
Middleware	Führt die Überprüfung und Validierung des Zugriffstokens durch
sda	Konstruiert die Haupt-API-Endpunkte für die NeIC SDA Data Out API.

Interne Komponenten

Komponente	Rolle
config	Paket zur Verwaltung der Konfiguration.
Datenbank	Bietet Funktionalitäten für die Nutzung der Datenbank sowie High-Level-Funktionen für die Arbeit mit der SDA-DB.
Lagerung	Bietet eine Schnittstelle für Speicherbereiche wie ein reguläres Dateisystem (POSIX) oder als S3-Objektspeicher.
Sitzung	DatasetCache speichert die Datensatzberechtigungen und Informationen, unabhängig davon, ob diese Informationen bereits überprüft wurden oder nicht. Diese Informationen können dann verwendet werden, um die zeitaufwändige Authentifizierungs-Middleware zu überspringen

Paketkomponenten

Komponente	Rolle
Autor	Auth pkg wird von der Middleware verwendet, um OIDC-Details zu analysieren und GA4GH-Visa aus einem GA4GH-Pass zu extrahieren
Anfrage	Dieses Paket speichert einen HTTP-Client, sodass dieser nicht bei jeder Anfrage initialisiert werden muss.