Veröffentlicht in: Analytical Chemistry 3. Februar 2021 [doi: 10.1021/acs.analchem.0c04565] https://doi.org/10.1021/acs.analchem.0c04565
Funktionen und eine Shiny-App zur Korrektur klassenbasierter Trennung von LC-MRM-MS-Lipidomics-Daten auf Isotopeninterferenzen. Online-Shiny-App verfügbar unter https://slinghub.shinyapps.io/LICAR/.
Sie können das Github-Repository (https://github.com/SLINGhub/LICAR.git) herunterladen und das Rstudio-Projekt öffnen. Alternativ können Sie dieses Repository auch mit Git klonen, z. B. in RStudio.
Die folgenden Pakete müssen in R installiert werden, um die Skripte auszuführen
enviPat
stringr
shiny
Öffnen Sie das Skript app.R
und klicken Sie auf die Schaltfläche „App ausführen“. Alternativ können Sie die App über starten, indem Sie shiny::runApp()
in die Konsole eingeben.
Einzelheiten zur Verwendung finden Sie im LICAR-Handbuch
Senden Sie ein Github-Issue oder eine Pull-Anfrage
Dem Original wurden mehrere Lipidklassen und Addukte hinzugefügt.
Bitte beachten Sie, dass das LICAR-Projekt mit einem Verhaltenskodex für Mitwirkende veröffentlicht wird. Indem Sie zu diesem Projekt beitragen, erklären Sie sich mit den Bedingungen einverstanden.