conStruct

Konstrukte (kontinuierliche Struktur) Readme

Dieses Repo enthält den Code für das Methodenkonstrukt - ein statistisches Instrument zur Modellierung kontinuierlicher und diskreter Populationsgenetische Struktur.

Die mit der Veröffentlichung verbundenen Manuskript-, Datendateien und Analysebücher, die "die genetische Struktur der kontinuierlichen und diskreten Bevölkerung über den Raum schließen", wurden bewegt und können unter den folgenden Links zugegriffen werden:

• Papier
• Manuskript -Repo
• Daten Dryad

Installation

Letzte Veröffentlichung

So installieren Sie die neueste Version des Konstrukt -R -Pakets:

install.packages( " conStruct " )

Bei der Installation werden die Konstruktmodelle kompiliert, die viel Text und möglicherweise einige Warnungen auf Ihren Bildschirm ausspucken können. Dies ist völlig normal, und Sie sollten nur besorgt sein, wenn Sie Fehler erhalten und die Installation fehlschlägt.

Entwicklungsversion

So installieren Sie die Entwicklungsversion von GitHub:

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Beachten Sie, dass Windows -Benutzer möglicherweise RTools als eigenständige ausführbare Datei herunterladen müssen, bevor Sie versuchen, das Konstrukt -R -Paket zu installieren.

Erste Schritte

Hier finden Sie ein komplettes Handbuch für alle dokumentierten Funktionen.

Darüber hinaus sind in dem Paket vier Vignetten enthalten, die im Detail in der Analysepipeline verschiedene Schritte durchlaufen. Sie können sie verwenden:

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

Es gibt auch eine Beispieldatendatei im Paket, die Sie mit dem Befehl laden können:

	data( conStruct.data )

Kontakt

Nachdem Sie sich auf das Handbuch und die Vignetten beziehen, leiten Sie bitte alle Fragen an Bradburd (at) umich.edu oder posten Sie als Ausgaben zum Git Repo.