MA_MA_meta

Ma_ma_meta

Repository für laufende Multi-Amts-Meta-Analyse-Bemühungen im NIH-Zentrum für Alzheimer und verwandte Demenz (Karte).

Abstrakt

Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) der Alzheimer-Krankheit werden trotz der bekannten Variation der genetischen Architektur und der Krankheitsprävalenz zwischen globalen Populationen überwiegend bei europäischen Vorfahren durchgeführt. Wir nutzten veröffentlichte und de novo gwas aus europäischen, ostasiatischen, afroamerikanischen und karibischen hispanischen Populationen, um die bisher größte Metaanalyse der Alzheimer-Krankheit durchzuführen. Diese Methode ermöglichte es uns, zwei unabhängige neuartige krankheitsassoziierte Loci auf Chromosom zu identifizieren. Wir haben auch verschiedene Haplotypstrukturen für Feinkomap-neun Loci genutzt und die Heterogenität bekannter Risikofaktoren über die Populationen hinweg global bewertet. Darüber hinaus verglichen wir die Generalisierbarkeit von multi-zeitlich- und einsteigeren polygenen Risikowerten in einer drei-mischenden kolumbianischen Bevölkerung. Unsere Ergebnisse unterstreichen die Bedeutung der Repräsentation von Multi-Hilfesrollen beim Aufdecken und Verständnis mutmaßlicher Faktoren, die zum Alzheimer-Krankheitsrisiko beitragen.

Links zum Manuskript

1. Vordruck
2. Veröffentlichung TBD

Überblick

1. Metaanalyse

   • MR-MEGA: Durchführen einer Mehrsteiger-Metaanalyse unter Verwendung von MR-Mega V0.2.
   • Zufällige und feste Effekte: Durchführung von multi-zeitlich festgelegten und zufälligen Effekten Meta-Analysen unter Verwendung von Plink v1.9.

2. Post-GWAs-Analysen

   • Identifizieren neuer Loci: Identifizierung potenziell neuer Loci durch Vergleich zu einer Liste bekannter AD -Loci.
   • Fein-Mapping: Fein Mapping mit MR-Mega, um 99% glaubwürdige Sets zu erstellen.
   • SMR: Zusammenfassende Mendelsche Randomisierung zur Nominierung von Suszeptibilitätsgenen bei neuartigen Loci.
   • PRS: Durchführen von polygenen Risiko -Score -Analysen und Bewertung der Leistung mit einer Empfängerbetreiberkurve.