APPIAN
1.0.0
Einführung
Installation
Dokumentation
3.1 Benutzerhandbuch
3.2 Entwicklerhandbuch
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Über uns
Geschäftsbedingungen
Die Appian -Pipeline wird in Python mit der Nipype -Bibliothek implementiert. Obwohl der Kern des Codes in Python geschrieben ist, kann die Pipeline Tools verwenden oder Module in jeder Programmiersprache einbeziehen. Die einzige Bedingung ist, dass die Tools in der Lage sein müssen, mit genau definierten Eingängen und Ausgängen aus einer Befehlszeile auszuführen. In diesem Sinne ist Appian Sprache agnostisch.
Appian ist 100% kostenlos und offen, aber im Austausch würden wir Ihr Feedback sehr zu schätzen wissen, ob es sich um Fehlerberichte handelt, Anfragen zum Hinzufügen neuer Funktionen, Fragen in unserer Mailingliste oder Vorschläge zur Verbesserung der Dokumentation oder der Dokumentation oder der Code. Sie können uns sogar eine E -Mail senden, um uns mitzuteilen, an welcher Art von Projekt Sie arbeiten!
APPIAN ist derzeit nur über Docker verfügbar. Docker ist eine Plattform zum Erstellen von Containern, die eine bestimmte Software in einem vollständigen Dateisystem verpacken, das alles enthält, was sie ausführen muss, und stellt sicher, dass die Software immer in derselben Umgebung ausgeführt werden kann. Dies bedeutet, dass sich alle von APPIAN geforderten Abhängigkeiten in seinem Docker -Container befinden (es ist nicht erforderlich, über den Versuch zu fummeln, obskure Bibliotheken zu kompilieren). Dies bedeutet jedoch auch, dass Sie Singularität oder Docker installieren müssen, bevor Sie fortfahren. Mach dir keine Sorgen, es ist sehr einfach (außer vielleicht für Windows). Eine Anleitung zum Installieren von Docker unter Ubuntu, Debian, Mac, Windows oder anderen Betriebssystemen finden Sie in diesem Link a.
Die Pipeline wird in Python mit der Nipype -Bibliothek implementiert. Obwohl der Kern in Python codiert ist, kann die Pipeline Tools verwenden oder Module in jeder Programmiersprache einbeziehen. Die einzige Bedingung ist, dass diese Tools aus einer Befehlszeile mit gut definierten Eingängen und Ausgängen ausgeführt werden müssen. In diesem Sinne ist APPIAN Sprache agnostisch. Wenn Docker oder Singularität installiert sind, führen Sie einfach die folgende Befehlszeile auf Ihrem Terminal aus:
docker pull tffunck/appian:latest
Das war's, APPIAN ist auf Ihrem Computer installiert.
Für diejenigen, die an Appian erweitert oder bei einem Beitrag zu erweitern sind, lesen Sie bitte unseren Entwicklerhandbuch.
Für weitere Informationen lesen Sie bitte unseren Benutzerhandbuch.
Für diejenigen, die an Appian erweitert oder beizutragen möchten, lesen Sie bitte unsere Richtlinien für Mitwirkende.
Funck T, Larcher K, Toussaint PJ, Evans AC, Thiel A (2018) Appian: Automatisierte Pipeline für PET -Bildanalyse. Front Neuroinform . PMCID: PMC6178989, doi: 10.3389/fninf.2018.00064
Appian automatisiertes QC ( zur Vorbereitung )
Wenn Sie stecken bleiben oder nicht wissen, wie Sie loslegen, senden Sie bitte eine E-Mail an [email protected]:
Thomas Funck, PhD -Kandidat ([email protected])
Kevin Larcher, MSc Eng.
Paule-Joanne Toussaint, PhD
Copyright 2017 Thomas Funck, Kevin Larcher
Die Berechtigung wird hiermit kostenlos an eine Person erteilt, die eine Kopie dieser Software und zugehörigen Dokumentationsdateien ("Software") erhält, um die Software ohne Einschränkung zu behandeln, einschließlich ohne Einschränkung der Rechte zu verwenden, zu kopieren, zu ändern, zusammenzuarbeiten , veröffentlichen, vertreiben, unterlizenzieren und/oder Kopien der Software verkaufen und Personen, denen die Software dazu bereitgestellt wird, unter den folgenden Bedingungen ermöglicht:
Die oben genannte Copyright -Mitteilung und diese Erlaubnisbekanntmachung müssen in alle Kopien oder wesentlichen Teile der Software enthalten sein.
Die Software wird "wie es ist" ohne Garantie jeglicher Art, ausdrücklich oder stillschweigend bereitgestellt, einschließlich, aber nicht beschränkt auf die Gewährleistung der Handelsfähigkeit, die Eignung für einen bestimmten Zweck und die Nichtverletzung. In keinem Fall haftet die Autoren oder Urheberrechtsinhaber für Ansprüche, Schäden oder andere Haftungen, sei es in einer Vertragsklage, unerlaubter Handlung oder anderweitig, aus oder im Zusammenhang mit der Software oder anderen Geschäften in der SOFTWARE.
