Der offizielle Server von Ninja Must Die 3 und der Kanalserver sind interoperabel. Spieler auf dem offiziellen Server können jedoch nicht auf dem Kanalserver angemeldet sein Auf dem offiziellen Server angemeldet ist das Gameplay zwar interoperabel, aber die Daten sind immer noch relativ unabhängig.
In Ninja Must Die 3 gibt es fünf Protagonisten mit unterschiedlichen Fähigkeiten und Attributen. Ninjas haben zwei verschiedene Schulen. Verschiedene Schulen haben unabhängige Ninjutsu und die entsprechenden Talentbäume können während des Kampfes gewechselt werden. Zwei Schulen desselben Ninjas können denselben Schatz tragen, Waffen können jedoch nicht vererbt werden.
Hinweise für Ninja Must Die 3 Spieler.
Spieler sollten beim Spielen von Ninja Must Die 3 aufpassen. Waffen in diesem Spiel können normalerweise aus Schatztruhen im Einkaufszentrum erhalten werden. Silberne Schatztruhen können Waffen der Stufe N~R erhalten, und goldene Schatztruhen können Waffen der Stufe R~SSR erhalten. Darüber hinaus können Spieler durch einige Aktivitäten auch Waffen erhalten. Waffen können in Knochen zerlegt werden, und Spieler können Knochen in bestimmten Geschäften gegen Schraubenschlüssel, SR/SSR-Waffen, verbesserte Hämmer und andere Requisiten eintauschen.