mcera5

Un paquete para descargar y procesar datos ERA5 listos para su uso en modelado de microclima. Artículo correspondiente que describe el paquete aquí en Methods in Ecology and Evolution .

Instalar

Puede instalar el paquete desde este repositorio de GitHub a través de la siguiente línea:
remotes::install_github("dklinges9/mcera5")

Noticias

8 de octubre de 2024 : en mcera5 se ha proporcionado modularidad para manejar archivos ERA5-reanálisis y ERA5-land descargados tanto del CDS antiguo (heredado) como del nuevo (beta). Además, los usuarios deben especificar si desean que los datos climáticos extraídos se formatee para un paquete R de microclima específico: microclima , NicheMapR , microclimc , microclimf o micropoint ( microclimc es el valor predeterminado). La rama "new_cds_time_edits" se ha fusionado con master y pronto se eliminará.

25 de septiembre de 2024 : Los archivos ERA5-reanalysis y ERA5-land descargados del CDS beta tienen una estructura diferente en su dimensión temporal. Para extraer datos climáticos de estos archivos (por ejemplo, usando extract_clim() ), consulte la rama de desarrollador "new_cds_time_edits". Puede instalar esta rama directamente a través de:

remotes::install_github("dklinges9/mcera5", ref = "new_cds_time_edits")

Septiembre de 2024 : este paquete está pasando por un gran desarrollo para mantenerse al día con los cambios a medida que ECMWF migra al nuevo Climate Data Store beta. Estos cambios incluyen límites de API más bajos, diferentes nombres de variables/estructuras de archivos netCDF y diferentes credenciales (consulte a continuación para obtener más detalles). Si se enfrenta a errores inexplicables, infórmemelos (consulte Preguntas, inquietudes y problemas a continuación).

Tutorial

Luego se puede acceder a la viñeta a través de:
vignette("mcera5_vignette")

Alternativamente, puede navegar hasta la viñeta manualmente aquí en el repositorio de GitHub.

Configuración

Los datos climáticos ERA5 se pueden descargar desde el almacén de datos climáticos (CDS) del ECMWF. Tenga en cuenta que en julio de 2024 el CDS migró a una nueva plataforma y la plataforma anterior quedó obsoleta en septiembre de 2024. A continuación se describe cómo acceder a los datos mediante R:

Regístrese para obtener una cuenta ECMWF aquí. Al registrarse, deberá aceptar todos los Términos y condiciones que figuran en la parte inferior del formulario.
Luego, navegue hasta el sitio de CDS aquí e inicie sesión usando el botón en la parte superior derecha. Una vez que haya iniciado sesión, coloque el mouse sobre su nombre en la parte superior derecha y haga clic en la opción "Su perfil" que aparece (esto debería llevarlo a esta página. Aquí encontrará su ID de usuario (UID) y su token de acceso personal. ambos son necesarios para descargar datos de forma remota desde el CDS. Tome nota de estos.
Cada conjunto de datos CDS tiene sus propios Términos de uso únicos. Deberá aceptar estos Términos para el reanálisis de ERA5 en esta página (desplácese hacia abajo hasta "Términos de uso" y acepte). Este mismo conjunto de términos también se aplica a otros productos de Copernicus, incluido ERA5-land.

Preguntas, inquietudes y problemas

Antes de enviar un correo electrónico sobre una inquietud, envíe un ejemplo reproducible como un problema en este repositorio de Github. Para hacerlo, navegue a la página principal de este repositorio y haga clic en la pestaña "Problemas" y luego en "Nueva edición". Si no tiene una cuenta de GitHub o no puede enviar un problema, comuníquese con David Klinges en [email protected].