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2024_09_2 (Q3 2024) Release

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RDKit

¿Qué es?

RDKit es una colección de software de quimioinformática y aprendizaje automático escrito en C++ y Python.

Licencia BSD: una licencia empresarial para código abierto
Estructuras de datos centrales y algoritmos en C++
Envoltorio Python 3.x generado usando Boost.Python
Envoltorios de Java y C# generados con SWIG
JavaScript (generado con emscripten) y contenedores CFFI en torno a funciones importantes
Operaciones moleculares 2D y 3D.
Generación de descriptores y huellas dactilares para aprendizaje automático
Cartucho de base de datos molecular para PostgreSQL que admite búsquedas de similitudes y subestructuras, así como muchas calculadoras de descriptores.
Nodos quimioinformáticos para KNIME
Carpeta de contribución con software útil aportado por la comunidad que aprovecha el poder de RDKit

Instalación y primeros pasos

Si estás trabajando en Python y usas conda (nuestra recomendación), la instalación es muy fácil:

 $ conda install -c conda-forge rdkit

Luego puede echar un vistazo a nuestra guía Introducción a Python.

Hay instrucciones de instalación más detalladas disponibles en Docs/Book/Install.md.

Documentación

Disponible en la página RDKit y en la carpeta Docs en GitHub

El blog de RDKit suele tener consejos y trucos útiles.

Soporte y comunidad

Si tiene preguntas, comentarios o sugerencias, los mejores lugares para hacerlo son:

Discusiones sobre GitHub
la lista de correo

Si encontró un error o desea solicitar una función, cree un problema

También tenemos un grupo de LinkedIn.

Tenemos una reunión anual de grupos de usuarios (UGM) donde los miembros de la comunidad hacen presentaciones y charlas relámpago sobre las cosas que han hecho con RDKit. Los materiales de UGM anteriores, que pueden ser bastante útiles, también están en línea: