RAPD
NB: este proyecto está en desarrollo y es de vanguardia. El código debería estabilizarse significativamente en junio de 2021.
Un paquete para solución automatizada de indexación, estrategia, integración, análisis y estructura de datos cristalográficos macromoleculares.
Actualmente estamos desarrollando capacidades para la línea de comandos y agregando detectores al software.
Comandos actuales:
- analizar: analiza un conjunto de datos MX y realiza pdbquery
- get_cif: obtiene un archivo CIF del PDB mediante un código de 4 caracteres
- get_pdb: obtiene un archivo PDB del PDB mediante un código de 4 caracteres
- hdf5_to_cbf - convierte archivos hdf5 a CBF
- índice: indexa datos MX y calcula estrategias de recopilación de datos
- integrar - integrar datos MX
- pdbquery: compara datos con estructuras de entrada, contaminantes comunes o estructuras en el PDB con parámetros de celda unitaria similares
Comandos del desarrollador:
- generar: crear nuevos archivos con plantilla RAPD
- print_detector - imprimir información del archivo de imagen
- python - CLI de Python con importaciones RAPD completas disponibles
- prueba - corredor de prueba para el proyecto RAPD
- versión: imprime la versión RAPD instalada actualmente
- xds_to_dict: transforma un XDS.INP en un dict de Python para incluirlo en el archivo del detector RAPD
Detectores de sitio actuales compatibles (hay más en camino):
APS
- aps_gmca_dectris_eiger16m
- lscat_dectris_eiger9m
- lscat_rayonix_mx300
- necat_dectris_eiger16m
- necat_dectris_pilatus6mf
- sercat_rayonix_mx300hs
UCLA
Para obtener instrucciones sobre instalación y configuración, consulte install/README.md
