scib reproducibility

Reproducibilidad scIB

Este repositorio contiene código complementario para reproducir los análisis presentados en el documento de evaluación comparativa de integración unicelular. Para otras partes del proyecto scIB, consulte estos repositorios:

• paquete scIB
• canalización scIB
• Datos utilizados en el estudio.

Algunos resultados complementarios se pueden ver en el sitio web de resultados en https://theislab.github.io/scib-reproducibility.

Estructura del directorio

• data/ - Archivos de datos con resultados de evaluación comparativa utilizados para crear cifras y el sitio web de resultados
• docs/ - El sitio web de resultados renderizados
• notebooks/ - Cuadernos de Jupyter utilizados para preparar métricas y conjuntos de datos de evaluación
• scripts/ - Código de análisis adicional
• visualization/ - Código para generar figuras y visualizaciones
• website/ - Código para generar el sitio web de resultados