conStruct

Construir (estructura continua) Readme

Este repositorio contiene el código para la construcción del método: una herramienta estadística para modelar una estructura genética de población continua y discreta.

El manuscrito, los archivos de datos y los scripts de análisis asociados con la publicación "inferen la estructura genética de la población continua y discreta en todo el espacio", se han movido y se puede acceder en los enlaces a continuación:

• papel
• repositorio de manuscrito
• Data Dryad

Instalación

Último lanzamiento

Para instalar la versión más reciente del paquete de constructo R:

install.packages( " conStruct " )

Tras la instalación, se compilarán los modelos de construcción , que pueden escupir mucho texto, y posiblemente algunas advertencias, a su pantalla. Esto es totalmente normal, y solo debe preocuparse si recibe errores y la instalación falla.

Versión de desarrollo

Para instalar la versión de desarrollo de GitHub:

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Tenga en cuenta que los usuarios de Windows pueden tener que descargar RTools como un ejecutable independiente antes de intentar instalar el paquete de construcción R.

Empezando

Un manual completo para todas las funciones documentadas está disponible aquí.

Además, hay cuatro viñetas incluidas en el paquete que caminan a través de varios pasos en la tubería de análisis en detalle. Puedes encontrarlos usando:

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

También hay un archivo de datos de ejemplo incluido en el paquete, que puede cargar usando el comando:

	data( conStruct.data )

Contacto

Después de referirse al manual y a las viñetas, dirija todas las consultas a Bradburd (at) umich.edu, o publique como problemas en el repositorio de Git.