stan

Stan es un paquete C ++ que proporciona

• Inferencia bayesiana completa utilizando la muestra de no-u-giratina (nueces), una variante de Hamiltonian Monte Carlo (HMC),
• inferencia bayesiana aproximada utilizando inferencia de variacional de diferenciación automática (AVENI) y
• Estimación de máxima verosimilitud penalizada (MLE) utilizando la optimización de L-BFGS.

Está construido sobre la biblioteca de stan matemáticas, que proporciona

• una biblioteca de diferenciación automática de primer y mayor orden basada en sobrecargas de plantilla de C ++, y
• Una matriz totalmente con plantilla, álgebra lineal y biblioteca de funciones especiales de probabilidad.

Hay interfaces disponibles en R, Python, Matlab, Julia, Stata, Mathematica y para la línea de comandos.

Página de inicio

La página de inicio de Stan, con enlaces a todo lo que necesitará usar Stan es:

http://mc-stan.org/

Interfaces

Hay repositorios separados en la organización Stan-Dev Github para las interfaces, bibliotecas de nivel superior y bibliotecas de nivel inferior.

Repositorio

El repositorio de código fuente de Stan está alojado aquí en GitHub.

Licencia

La Biblioteca de Matemáticas de Stan, Core Stan Code y Cmdstan tienen licencia bajo el nuevo BSD. Rstan y Pystan tienen licencia bajo GPLV3, y otras interfaces tienen otras licencias de código abierto.

Tenga en cuenta que la biblioteca STAN Math depende de la biblioteca Intel TBB que tiene licencia bajo la licencia Apache 2.0. Esta dependencia implica una restricción adicional en comparación con el nuevo Lincense BSD solo. La licencia Apache 2.0 es incompatible con el código con licencia GPL-2 si se distribuye como un binario unitario. Puede consultar la página de licencias en el Wiki Stan.