mcera5

Un package pour télécharger et traiter les données ERA5 prêtes à être utilisées dans la modélisation du microclimat. Article correspondant décrivant le package ici dans Methods in Ecology and Evolution .

Installer

Vous pouvez installer le package à partir de ce référentiel GitHub via la ligne suivante :
remotes::install_github("dklinges9/mcera5")

Nouvelles

8 octobre 2024 : la modularité pour gérer les fichiers de réanalyse ERA5 et ERA5-land téléchargés à partir de l'ancien CDS (ancien) et du nouveau CDS (bêta) a été fournie dans mcera5 . De plus, les utilisateurs doivent spécifier s'ils souhaitent que les données climatiques extraites soient formatées pour un package R microclimat spécifique : microclima , NicheMapR , microclimc , microclimf ou micropoint ( microclimc est la valeur par défaut). La branche "new_cds_time_edits" a été fusionnée avec master et sera bientôt supprimée.

25 septembre 2024 : Les fichiers de réanalyse ERA5 et ERA5-land téléchargés à partir du CDS bêta ont une structure différente de leur dimension temporelle. Pour extraire les données climatiques de ces fichiers (par exemple en utilisant extract_clim() ), veuillez consulter la branche développeur "new_cds_time_edits". Vous pouvez installer cette branche directement via :

remotes::install_github("dklinges9/mcera5", ref = "new_cds_time_edits")

Septembre 2024 : ce package subit de nombreux développements pour suivre les changements à mesure que l'ECMWF migre vers la nouvelle version bêta du Climate Data Store. Ces modifications incluent des limites d'API inférieures, des noms de variables/structures de fichiers netCDF différents et des informations d'identification différentes (voir ci-dessous pour plus de détails). Si vous rencontrez des erreurs inexplicables, veuillez les porter à mon attention (voir Questions, préoccupations et problèmes ci-dessous).

Tutoriel

La vignette est ensuite accessible via :
vignette("mcera5_vignette")

Vous pouvez également accéder manuellement à la vignette ici sur le référentiel GitHub.

Installation

Les données climatiques ERA5 peuvent être téléchargées à partir de la banque de données climatiques (CDS) du CEPMMT. Notez qu'en juillet 2024, le CDS a migré vers une nouvelle plate-forme et que l'ancienne plate-forme est devenue obsolète en septembre 2024. Ce qui suit décrit comment accéder aux données à l'aide de R :

Créez un compte ECMWF ici. Lors de votre inscription, vous devrez accepter toutes les conditions générales énumérées au bas du formulaire.
Ensuite, accédez au site CDS ici et connectez-vous à l'aide du bouton en haut à droite. Une fois connecté, passez votre souris sur votre nom en haut à droite, et cliquez sur l'option "Votre profil" qui apparaît (cela devrait vous amener à cette page. Vous y trouverez votre identifiant (UID) et votre jeton d'accès personnel, tous deux nécessaires pour télécharger à distance des données à partir du CDS. Notez-les.
Chaque ensemble de données CDS possède ses propres conditions d'utilisation. Vous devrez accepter ces conditions pour la réanalyse ERA5 sur cette page (faites défiler jusqu'à « Conditions d'utilisation » et acceptez). Ce même ensemble de conditions s'applique également à d'autres produits Copernicus, y compris ERA5-land.

Questions, préoccupations, problèmes

Avant d'envoyer un e-mail concernant un problème, veuillez soumettre un exemple reproductible en tant que problème sur ce référentiel Github. Pour ce faire, accédez à la page principale de ce référentiel et cliquez sur l'onglet « Problèmes », puis sur « Nouveau problème ». Si vous n'avez pas de compte GitHub ou si vous ne parvenez pas à soumettre un problème, contactez David Klinges à [email protected].