téléchargement sda

Avis d'archives

️ Ce référentiel n'est plus maintenu. Le code a été intégré et développé davantage sur : https://github.com/neicnordic/sensitive-data-archive

Téléchargement SDA

sda-download est une implémentation go de l'API Data Out. La référence API contient des exemples de requêtes et de réponses.

Déploiement

La méthode d’approvisionnement recommandée pour la production est :

• sur un kubernetes cluster à l'aide de la charte helm ;

Pour le développement/test local, consultez les instructions dans le dossier dev_utils. Il existe un fichier README dans le dossier dev_utils avec des sections permettant d'exécuter le pipeline localement à l'aide de Docker Compose.

• Première course
• Production comme run
• Exécution manuelle

Composants API

Composant	Rôle
intergiciel	Effectue la vérification et la validation du jeton d'accès
sda	Construit les principaux points de terminaison de l'API pour l'API NeIC SDA Data Out.

Composants internes

Composant	Rôle
configuration	Package de gestion de la configuration.
base de données	Fournit des fonctionnalités pour utiliser la base de données, ainsi que des fonctions de haut niveau pour travailler avec la SDA-DB.
stockage	Fournit une interface pour les zones de stockage telles qu'un système de fichiers standard (POSIX) ou un magasin d'objets S3.
session	DatasetCache stocke les autorisations et les informations de l'ensemble de données, que ces informations aient déjà été vérifiées ou non. Ces informations peuvent ensuite être utilisées pour éviter le middleware d'authentification coûteux en temps.

Composants du package

Composant	Rôle
authentification	Auth pkg est utilisé par le middleware pour analyser les détails OIDC et extraire les visas GA4GH d'un passeport GA4GH.
demande	Ce paquet stocke un client HTTP, de sorte qu'il n'a pas besoin d'être initialisé à chaque requête.