taxreturn
v0.1
taxreturn est un package R permettant de récupérer des séquences de codes-barres d'ADN et des annotations taxonomiques associées à partir de bases de données publiques telles que la base de données Barcode of Life (BOLD) et NCBI GenBank, de conserver ces séquences et de les formater dans des ensembles d'entraînement compatibles avec les classificateurs taxonomiques populaires utilisés pour le métabarcodage et les marqueurs. analyse génétique.
Ce package est encore en développement et n'est pas encore disponible sur CRAN. Vous pouvez installer la version de développement depuis GitHub avec :
install.packages( " devtools " )
devtools :: install_github( " alexpiper/taxreturn " )
library( taxreturn )
Le site Web du package contient la documentation des fonctions et un exemple pas à pas.