scib reproducibility

Reproductibilité du scIB

Ce référentiel contient du code supplémentaire pour reproduire les analyses présentées dans le document d'analyse comparative de l'intégration unicellulaire. Pour d'autres parties du projet scIB, consultez ces référentiels :

• paquet scIB
• pipeline scIB
• Données utilisées dans l'étude

Certains résultats supplémentaires peuvent être consultés sur le site Web des résultats à l'adresse https://theislab.github.io/scib-reproducibility.

Structure du répertoire

• data/ - Fichiers de données avec les résultats d'analyse comparative utilisés pour créer des chiffres et le site Web des résultats
• docs/ - Le site des résultats rendus
• notebooks/ - Notebooks Jupyter utilisés pour préparer les ensembles de données et les métriques d'évaluation
• scripts/ - Code d'analyse supplémentaire
• visualization/ - Code pour générer des figures et des visualisations
• website/ - Code de génération du site web des résultats