lyprox
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Il s'agit d'une application Web Django qui affiche les schémas détaillés des métastases lymphatiques dans le cancer de la tête et du cou et permet d'explorer le ou les ensembles de données sous-jacents de manière très détaillée. Il est hébergé sous l'URL https://lyprox.org.
Le HNSCC se propage à travers le système lymphatique du cou et forme des métastases dans les ganglions lymphatiques régionaux. Les métastases macroscopiques peuvent être détectées grâce à des modalités d'imagerie telles que l'IRM, la TEP et la tomodensitométrie. Ils sont alors par conséquent inclus dans le volume cible, lorsque la radiothérapie est choisie dans le cadre du traitement. Cependant, les métastases microscopiques sont trop petites pour être diagnostiquées avec les techniques d'imagerie actuelles.
Pour tenir compte de cette implication microscopique, des parties du système lymphatique sont souvent irradiées de manière élective pour augmenter le contrôle de la tumeur. Les parties incluses dans ce volume cible clinique électif sont actuellement décidées sur la base des lignes directrices 1 2 3 4 . Ceux-ci sont à leur tour dérivés de rapports sur la prévalence de l'implication par niveau de ganglion lymphatique (LNL), c'est-à-dire la proportion de patients chez lesquels des métastases ont été diagnostiquées dans un LNL donné, stratifiées par emplacement de la tumeur primaire. Il est recommandé d'inclure un LNL dans le volume cible électif si 10 à 15 % des patients ont montré une implication à ce niveau particulier.
Cependant, bien que la prévalence de l'implication ait été rapportée dans la littérature 5 6 et que les voies générales de drainage lymphatique soient bien comprises, les schémas de progression détaillés du HNSCC restent mal quantifiés. Nous pensons que le risque d'implication microscopique dans un LNL dépend fortement du diagnostic spécifique d'un patient particulier et que son traitement peut donc être personnalisé si les schémas de progression étaient mieux quantifiés.
Avec l'interface, notre objectif principal est de rendre notre ensemble de données extraites facilement accessible. En le visualisant de manière interactive, on peut très rapidement tester ou émettre des hypothèses concernant la propagation lymphatique du HNSCC. Espérons que cela motivera à son tour d’autres chercheurs à étudier ces hypothèses, à extraire et à partager davantage de données avec le même niveau de détail.
Ceci, à son tour, nous permettrait (ou à n’importe qui, vraiment) de créer des modèles de progression tumorale plus précis et plus précis. Par exemple, comme des travaux antérieurs sur l'utilisation des réseaux bayésiens pour prédire la probabilité personnalisée d'implication 7 ou notre récente publication sur cette question utilisant des modèles de Markov cachés et introduisant ainsi une manière explicite de modéliser le temps 8 .
Les données visualisées dans cette interface résident dans un référentiel open source : lyDATA.
Nous avons également publié un article sur l'ensemble de données et l'interface dans Radiotherapy & Oncology 9 , avec une prépublication disponible sur medRxiv 10 .
Nous travaillons également sur des modèles probabilistes 7 8 susceptibles de prédire la propagation lymphatique du cancer de la tête et du cou. Le code sous-jacent est hébergé dans un autre référentiel : lymph.
Vous pouvez contribuer à ce projet de deux manières :
Si vous souhaitez héberger vos données vous-même ou essayer l'apparence de vos données dans l'application Web sans vous engager dans un téléchargement, n'hésitez pas à suivre ces instructions pour les rendre opérationnelles sur votre ordinateur local.
Vincent Grégoire et autres, Sélection et délimitation des volumes cibles des ganglions lymphatiques en radiothérapie conformationnelle de la tête et du cou. Proposition de standardisation de la terminologie et de la procédure basée sur l'expérience chirurgicale , Radiothérapie et Oncologie , vol. 56, pp. 135-150, 2000, doi : https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4. ↩
Vincent Grégoire, A. Eisbruch, M. Hamoir et P. Levendag, Proposition de délimitation du CTV nodal dans le cou ganglionnaire et postopératoire , Radiothérapie et Oncologie , vol. 79, non. 1, pp. 15-20, avril 2006, doi : https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009. ↩
Vincent Grégoire et al., Délimitation des niveaux ganglionnaires du cou pour les tumeurs de la tête et du cou : une mise à jour 2013. DAHANCA, EORTC, HKNPCSG, NCIC CTG, NCRI, RTOG, TROG lignes directrices consensuelles , Radiothérapie et oncologie , vol. 110, non. 1, pp. 172-181, janvier 2014, doi : https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010. ↩
Julian Biau et al., Sélection des volumes cibles des ganglions lymphatiques pour une radiothérapie définitive de la tête et du cou : une mise à jour 2019 , Radiothérapie et oncologie , vol. 134, pp. 1-9, mai 2019, doi : https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018. ↩
Jatin. P. Shah, FC Candela et AK Poddar, Les modèles de métastases ganglionnaires cervicales du carcinome épidermoïde de la cavité buccale , Cancer , vol. 66, non. 1, pp. ↩
Laurence Bauwens et al., Prévalence et distribution des métastases ganglionnaires cervicales dans les carcinomes épidermoïdes oropharyngés HPV-positifs et HPV-négatifs , Radiothérapie et oncologie , vol. 157, pp. 122-129, avril 2021, doi : https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028. ↩
Bertrand Pouymayou, P. Balermpas, O. Riesterer, M. Guckenberger et J. Unkelbach, Un modèle de réseau bayésien de progression tumorale lymphatique pour une définition élective personnalisée du CTV dans les cancers de la tête et du cou , Physique en médecine et biologie , vol. 64, non. 16, p. 165003, août 2019, doi : https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18. ↩ ↩ 2
Roman Ludwig, B. Pouymayou, P. Balermpas et J. Unkelbach, Un modèle de Markov caché pour la progression des tumeurs lymphatiques de la tête et du cou , Sci Rep , vol. 11, non. 1, p. 12261, décembre 2021, doi : https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1. ↩ ↩ 2
Roman Ludwig et al., Rapport détaillé patient-individuel sur l'implication des ganglions lymphatiques dans le carcinome épidermoïde oropharyngé avec une interface en ligne , Radiothérapie et oncologie , février 2022, doi : https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035. ↩
Roman Ludwig, J.-M. Hoffmann, B. Pouymayou et al., Rapport détaillé patient-individuel sur l'implication des ganglions lymphatiques dans le carcinome épidermoïde oropharyngé avec une interface en ligne , medRxiv , décembre 2021. doi : https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001. ↩
