stan

Stan est un package C ++ fournissant

• Inférence bayésienne complète à l'aide de l'échantillonneur de non-tour (noix), une variante de Hamiltonian Monte Carlo (HMC),
• inférence bayésienne approximative en utilisant l'inférence variationnelle de différenciation automatique (ADVI), et
• PENALISÉ ESTIMATION DU MAXIMUM DE COMMÉDICATION (MLE) en utilisant l'optimisation L-BFGS.

Il est construit sur la bibliothèque de mathématiques Stan, qui fournit

• une bibliothèque de différenciation automatique complète de premier ordre et de premier ordre basé sur des surcharges de modèle C ++, et
• Une matrice entièrement compliquée, une algèbre linéaire et une bibliothèque de fonctions spéciales de probabilité.

Il existe des interfaces disponibles en R, Python, Matlab, Julia, Stata, Mathematica et pour la ligne de commande.

Page d'accueil

La page d'accueil de Stan, avec des liens vers tout ce dont vous aurez besoin pour utiliser Stan est:

http://mc-stan.org/

Interfaces

Il existe des référentiels distincts dans l'organisation Stan-Dev GitHub pour les interfaces, les bibliothèques de niveau supérieur et les bibliothèques de niveau inférieur.

Référentiel source

Le référentiel de code source de Stan est hébergé ici sur GitHub.

Licence

La bibliothèque de mathématiques Stan, le code Stan Core et le CMDSTAN sont sous licence de nouveaux BSD. RSTAN et PYSTAN sont sous licence GPLV3, avec d'autres interfaces ayant d'autres licences open source.

Notez que la bibliothèque de mathématiques Stan dépend de la bibliothèque Intel TBB qui est sous licence Apache 2.0. Cette dépendance implique une restriction supplémentaire par rapport au nouveau BSD Lincence seul. La licence Apache 2.0 est incompatible avec le code sous licence GPL-2 s'il est distribué en tant que binaire unitaire. Vous pouvez vous référer à la page de licence sur le Wiki Stan.