kraken2
v2.1.3
La deuxième version du système de classification des séquences taxonomiques Kraken
Veuillez vous référer au manuel d'exploitation (dans docs/MANUAL.html ) pour plus de détails sur la façon d'utiliser Kraken 2.
Pour des détails de mise en œuvre supplémentaires et des conseils sur l'utilisation de Kraken 2, vous pouvez également vous référer à:
L'article décrivant la première version de Kraken. Notez que Kraken 2 est une réécriture de Kraken 1 et n'est pas compatible en arrière avec Kraken 1.
L'article décrivant Krakenuniq. Les fonctionnalités basées sur HLL de Krakenuniq sont incorporées dans Kraken 2 lors de l'utilisation du drapeau --report-minimizer-data décrit dans le manuel d'exploitation.
Le papier Kraken 2.
Un document de protocole décrivant l'utilisation de Kraken 2.
