ViMO

Vimo

Visualizer for Meta-Omics (VIMO) est une application interactive basée sur R-Siny pour faciliter l'intégration des données entre la métagénomique, la métatranscriptomique et la métaprotéomique. Dans le même temps, Vimo vise à fournir à l'utilisateur des représentations graphiques interactives, prêtes à la publication et pertinentes des données.

Vimo est accessible en ligne ici:
https://magnusarntzen.shinyapps.io/visualizerformetaomics/

Vimo intégrer les données de

• Métagénomique
• Métatranscriptomique
• Métaprotéomique
• Taxonomie
• Mesures de qualité
• Fonctions KEGG et complétion du module
• Enzymes en glucides (cazymes)

Vimo fait des complots de:

• Qualité magique
• Mag Abondance dans divers fichiers
• Catégories de cazyme dans divers magazines et leurs abondances au niveau des transcrits et des protéines
• Catégories KEGG dans divers magazines et leurs abondants au niveau des transcrits et des protéines
• Fractions d'achèvement du module KEGG pour voir le potentiel métabolique pour chaque mag

Un exemple de sortie:

Rapports de bogues

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