マセラ5

微気候モデリングですぐに使用できる ERA5 データをダウンロードして処理するためのパッケージ。このパッケージについて説明している対応する論文は、「Methods in Ecology and Evolution」にあります。

インストール

次の行を使用して、この GitHub リポジトリからパッケージをインストールできます。
remotes::install_github("dklinges9/mcera5")

ニュース

2024 年 10 月 8 日: 古い (レガシー) CDS と新しい (ベータ) CDS の両方からダウンロードされた ERA5-再解析および ERA5-land ファイルを処理するためのモジュール性がmcera5で提供されました。さらに、ユーザーは、抽出された気候データを特定の microclimate R パッケージ ( microclima 、 NicheMapR 、 microclimc 、 microclimf 、またはmicropoint ) 用にフォーマットするかどうかを指定する必要があります ( microclimcがデフォルトです)。ブランチ「new_cds_time_edits」はマスターにマージされており、まもなく削除されます。

2024 年 9 月 25 日: ベータ版 CDS からダウンロードされた ERA5-再解析および ERA5-land ファイルは、時間次元の構造が異なります。これらのファイルから気候データを抽出するには ( extract_clim()を使用するなど)、開発者ブランチ「new_cds_time_edits」を参照してください。このブランチは次の方法で直接インストールできます。

remotes::install_github("dklinges9/mcera5", ref = "new_cds_time_edits")

2024 年 9 月: ECMWF が新しいベータ版の Climate Data Store に移行するため、このパッケージは変更に対応するために多くの開発が行われています。これらの変更には、API 制限の引き下げ、異なる変数名/netCDF ファイル構造、異なる認証情報が含まれます (詳細は以下を参照)。説明できないエラーが発生した場合は、私に知らせてください (以下の質問、懸念事項、問題を参照)。

チュートリアル

ビネットには次の方法でアクセスできます。
vignette("mcera5_vignette")

あるいは、GitHub リポジトリで手動でビネットに移動することもできます。

設定

ERA5 気候データは、ECMWF 気候データストア (CDS) からダウンロードできます。 2024 年 7 月に CDS が新しいプラットフォームに移行され、古いプラットフォームは 2024 年 9 月に廃止されたことに注意してください。以下では、R を使用してデータにアクセスする方法について説明します。

ここからECMWFアカウントに登録してください。登録時には、フォームの下部に記載されているすべての利用規約に同意する必要があります。
次に、こちらの CDS サイトに移動し、右上のボタンを使用してログインします。ログインしたら、右上の自分の名前の上にマウスを置き、表示される「プロフィール」オプションをクリックします (このページが表示されます。ここでユーザー ID (UID) とパーソナルアクセストークンが表示されます。これらは両方とも CDS からデータをリモートでダウンロードするために必要です。
各 CDS データセットには独自の利用規約があります。このページで ERA5 再分析に関するこれらの規約に同意する必要があります (「利用規約」まで下にスクロールして同意します)。これと同じ一連の条件が、ERA5-land を含む他の Copernicus 製品にも適用されます。

質問、懸念、問題

懸念事項について電子メールで送信する前に、この Github リポジトリの問題として再現可能な例を送信してください。これを行うには、このリポジトリのメインページに移動し、[問題] タブをクリックして、[新しい問題] をクリックします。 GitHub アカウントをお持ちでない場合、または問題を送信できない場合は、David Klinges ([email protected]) までご連絡ください。