オパール

オパール

Opal は、バイオバンクまたは疫学研究のための OBiBa の中核データベース アプリケーションです。

• ダウンロード手順を参照してください。
• ドキュメントを読んでください。
• バグや質問がありますか? GitHub で問題を作成してください。
• 継続的インテグレーションは Travis 上で行われます。

開発者

開発環境をセットアップします。

• Java8 が利用可能であることを確認してください。
• MongoDB、MySQL、または MariaDB データベースが実行されていることを確認してください。
• make allでコンパイルする
• シード材料を入手するには、obiba-home リポジトリを取得します。
• 実行環境を準備します: make prepare (一度だけ実行します。これにより、opal_home ディレクトリが作成されます)
• デバッグモードで実行: make debug
• 管理者/パスワード資格情報を使用して http://localhost:8080 にログインします。
• データベースを宣言します (最初の接続時のみ)
• obiba-homeプロジェクトに行ってmake seed-opal

他にも多くのターゲットがあります。Makefileを確認し、環境に合わせて変数を変更してください。

メーリングリスト

質問がありますか?メーリングリストで質問してください！

[email protected]

http://groups.google.com/group/obiba-users

ライセンス

OBiBa ソフトウェアはオープンソースであり、GPL3 ライセンスの下で利用可能です。 OBiBa ソフトウェアは無料です。

OBiBa の謝辞

OBiBa ソフトウェアを使用している場合は、コード、Web サイト、出版物、またはレポートで OBiBa の成果を引用してください。

「ここで紹介する研究は、Maelstrom Research (www.maelstrom-research.org) と Epigeny (www.epigeny.io) によって開発されたソフトウェア スイートである OBiBa スイート (www.obiba.org) を使用して可能になりました。」