rdkit

RDKit

それは何ですか？

RDKit は、C++ と Python で書かれたケモインフォマティクスおよび機械学習ソフトウェアのコレクションです。

• BSD ライセンス - ビジネス向けのオープンソース向けライセンス
• C++ のコア データ構造とアルゴリズム
• Boost.Python を使用して生成された Python 3.x ラッパー
• SWIG で生成された Java および C# ラッパー
• JavaScript (emscripten で生成) および重要な機能を囲む CFFI ラッパー
• 2D および 3D 分子操作
• 機械学習のための記述子とフィンガープリントの生成
• 部分構造および類似性の検索と多くの記述子計算をサポートする PostgreSQL 用の分子データベース カートリッジ
• KNIME のケマインフォマティクス ノード
• RDKit の機能を活用したコミュニティ提供の便利なソフトウェアが含まれる Contrib フォルダー

インストールと開始

Python で作業し、conda (推奨) を使用している場合、インストールは非常に簡単です。

 $ conda install -c conda-forge rdkit

その後、Python 入門ガイドを参照してください。

より詳細なインストール手順は、Docs/Book/Install.md で参照できます。

ドキュメント

RDKit ページおよび GitHub の Docs フォルダーで入手可能

RDKit ブログには、役立つヒントやコツがたくさん掲載されています。

サポートとコミュニティ

質問、コメント、提案がある場合は、次の場所にアクセスしてください。

• GitHub ディスカッション
• メーリングリスト

バグを見つけた場合、または機能をリクエストしたい場合は、問題を作成してください。

LinkedIn グループもあります

私たちは年に一度のユーザー グループ ミーティング (UGM) を開催しており、コミュニティのメンバーが RDKit で行ったことについてプレゼンテーションやライトニング トークを行っています。非常に役立つ過去の UGM の資料もオンラインにあります。

• 2012 UGM、ロンドン
• 2013 UGM、ヒンクストン
• 2014 UGM、ダルムシュタット
• 2015 UGM、チューリッヒ
• 2016 UGM、バーゼル
• 2017 UGM、ベルリン
• 2018 UGM、ケンブリッジ
• 2019 UGM、ハンブルク
• 2020 UGM、仮想
• 2021 UGM、仮想
• 2022 UGM、ベルリン
• 2023 UGM、マインツ
• 2024年UGM、チューリッヒ

ライセンス

コードはBSDライセンスに基づいてリリースされています。