elastix へようこそ: 画像のリジッドおよび非リジッド位置合わせのためのツールボックスです。
elastix は、よく知られた Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) をベースにしたオープン ソース ソフトウェアです。このソフトウェアは、(医療) 画像レジストレーションを実行するために一般的に使用されるアルゴリズムのコレクションで構成されています。つまり、関連する画像類似性メトリクスを最適化することによって、空間変換を見つけ、1 つの画像 (固定画像) を別の画像 (動画) にマッピングするタスクです。 。 elastix のモジュール設計により、ユーザーは特定のアプリケーションのさまざまな登録方法を迅速に構成、テスト、比較できます。コマンドライン インターフェイスを使用すると、スクリプトによる大量のデータ セットの自動処理が可能になります。現在、elastix には ITKElastix が付属しており、これを Python (Pypi 上) で利用できるようになり、SimpleElastix によって C++、Python、Java、R、Ruby、C#、Lua などの言語で利用できるようになります。最新の elastix ビルドの docker イメージも dockerhub から入手できます。グラフィカル ユーザー インターフェイスで elastix の機能を使用したい人のために、napari プラグインや 3Dslicer プラグインなど、いくつかのプラグインが存在します。
elastix の主任開発者は Stefan Klein と Marius Staring です。このソフトウェアは当初、Josien PW Pluim の監督の下、画像科学研究所で開発されました。現在、多くの人が Elasticx に貢献しています。
このソフトウェアをどこかで使用する場合は、次の記事を引用していただければ幸いです。
Elasticx の特定のコンポーネントは多くの企業によって作成されています。関連する引用はここにあります。さらに、Zenodo の elastix DOI 識別子を使用して、特定のソフトウェア リリースを参照できます: https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.13366181
広範なマニュアルや動物園のモデルなどの詳細情報は、Wiki で見つけることができます。
インタラクティブなチュートリアルは、Jupyter ノートブックで利用できます。
メーリング リストに登録して質問することもできます。 elastixへの貢献に関する情報は、こちらでご覧いただけます。
