sdaダウンロード

アーカイブのお知らせ

️このリポジトリは維持されなくなりました。コードは統合されており、https://github.com/neicnordic/sensitive-data-archive でさらに開発されています。

SDAのダウンロード

sda-download Data Out API のgo実装です。 API リファレンスには、リクエストとレスポンスの例が記載されています。

導入

本番環境に推奨されるプロビジョニング方法は次のとおりです。

• kubernetes cluster上では Helm チャートを使用します。

ローカル開発/テストについては、dev_utils フォルダーの手順を参照してください。 dev_utils フォルダーには、Docker Compose を使用してパイプラインをローカルで実行するためのセクションを含む README ファイルがあります。

• 最初の実行
• 実行のような生産
• 手動実行

APIコンポーネント

成分	役割
ミドルウェア	アクセストークンの検証と検証を実行します
sda	NeIC SDA データ出力 API のメイン API エンドポイントを構築します。

内部コンポーネント

成分	役割
構成	構成を管理するためのパッケージ。
データベース	データベースを使用するための機能と、SDA-DB を操作するための高レベルの機能を提供します。
ストレージ	通常のファイル システム (POSIX) や S3 オブジェクト ストアなどのストレージ領域のインターフェイスを提供します。
セッション	DatasetCache には、データセットのアクセス許可と、この情報がすでにチェックされているかどうかを示す情報が保存されます。この情報を使用して、時間のかかる認証ミドルウェアをスキップできます。

パッケージのコンポーネント

成分	役割
認証	Auth pkg は、OIDC 詳細を解析し、GA4GH パスポートから GA4GH ビザを抽出するためにミドルウェアによって使用されます。
リクエスト	このパッケージには HTTP クライアントが格納されているため、リクエストごとに初期化する必要はありません。