LICAR

発行: Analytical Chemistry 2021 年 2 月 3 日 [doi: 10.1021/acs.analchem.0c04565] https://doi.org/10.1021/acs.analchem.0c04565

ライカー

同位体干渉についてクラスベースの分離 LC-MRM-MS リピドミクス データを修正する機能と Shiny アプリ。オンライン Shiny アプリは https://slinghub.shinyapps.io/LICAR/ から入手できます。

コードをダウンロードする

Github リポジトリ (https://github.com/SLINGhub/LICAR.git) をダウンロードして、Rstudio プロジェクトを開くことができます。あるいは、RStudio などで git を使用してこのリポジトリのクローンを作成することもできます。

前提条件

スクリプトを実行するには、次のパッケージを R にインストールする必要があります

• enviPat
• stringr
• shiny

Shiny アプリを実行する

スクリプトapp.Rを開き、「アプリの実行」ボタンをクリックします。あるいは、コンソールでshiny::runApp()と入力してアプリを起動することもできます。

マニュアル

詳しい使用方法については、LICARのマニュアルを参照してください。

バグを報告して貢献する

Github Issue または Pull request を送信する

2021 年 11 月の更新

いくつかの脂質クラスと付加物がオリジナルに追加されました。

接触

• Gao Liang ([email protected])
• アマウリー・カズナーヴ・ガシオ([email protected])

行動規範

LICAR プロジェクトは、貢献者の行動規範とともにリリースされていることに注意してください。このプロジェクトに貢献すると、その規約に従うことに同意したことになります。