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lyproxとは何ですか？

これは、頭頸部がんのリンパ転移の詳細なパターンを表示し、基礎となるデータセットを詳細に調査できるようにする Django Web アプリです。 URL https://lyprox.org でホストされています。

モチベーション

HNSCC は首のリンパ系を通って広がり、所属リンパ節に転移を形成します。肉眼的転移は、MRI、PET、CT スキャンなどの画像診断手段で検出できます。したがって、治療の一部として放射線療法が選択される場合、それらはターゲットボリュームに含まれます。しかし、顕微鏡的な転移は小さすぎるため、現在の画像技術では診断できません。

この顕微鏡的な関与を説明するために、腫瘍制御を強化するためにリンパ系の一部が選択的に放射線照射されることがよくあります。この選択的臨床目標ボリュームにどの部分が含まれるかは、現在、ガイドライン¹ ² ³ ⁴に基づいて決定されています。これらは、リンパ節レベル (LNL) ごとの関与の有病率、つまり、原発腫瘍の位置によって層別化された、特定の LNL で転移と診断された患者の部分の報告に基づいています。患者の 10 ～ 15% が特定のレベルへの関与を示した場合は、選択的ターゲットボリュームに LNL を含めることをお勧めします。

しかし、関与の有病率は文献⁵ ⁶で報告されており、一般的なリンパ排液経路はよく理解されていますが、HNSCC の詳細な進行パターンは十分に定量化されていないままです。私たちは、LNL への顕微鏡的関与のリスクは、特定の患者の具体的な診断に大きく依存しており、したがって、進行パターンがより適切に定量化されれば、患者の治療を個別化できると考えています。

私たちの目標

このインターフェイスでは、抽出されたデータセットに簡単にアクセスできるようにすることを主な目的としています。インタラクティブに視覚化することで、HNSCC のリンパ管への広がりを非常に迅速に検証したり、仮説を立てたりすることができます。これにより、他の研究者がこれらの仮説を調査し、同様の詳細でより多くのデータを抽出して共有するようになることを願っています。

これにより、私たち (または実際には誰でも) より正確で正確な腫瘍進行モデルを構築できるようになります。たとえば、ベイジアンネットワークを使用して個人化された関与の確率を予測する以前の研究⁷や、隠れマルコフモデルを使用してこの問題に関する最近の出版物と同様に、時間をモデリングする明示的な方法を導入しています⁸ 。

リンパ進行パターンのデータセット

このインターフェイスで視覚化されるデータは、独自のオープンソースリポジトリ lyDATA に存在します。

また、このデータセットとインターフェースに関する論文もRadiotherapy & Oncology ⁹に発表しており、プレプリントはmedRxiv ¹⁰で入手できます。

パーソナライズされた CTV 定義のための確率モデル

私たちはまた^{、頭頸部がんのリンパ管への広がりを予測する可能性のある確率モデル 7、8}^にも取り組んでいます。基礎となるコードは別のリポジトリ、lymph でホストされています。

貢献方法

このプロジェクトに貢献するには 2 つの方法があります。

あなたがこの分野の臨床研究者で、データを私たちと共有したい場合は、電子メールでご連絡ください: [email protected]。
もう 1 つの方法は、たとえばソフトウェア開発者の場合、このリポジトリに貢献することです。この Django アプリの範囲が非常に特殊であるため、これは少し可能性が低いと思いますが、それでも貢献を歓迎します。この場合、ソースコードの詳細なドキュメントは GitHub ページにあります。

このインターフェースをローカルで実行する

データを自分でホストしたい場合、またはアップロードをコミットせずに Web アプリでデータがどのように表示されるかを試してみたい場合は、次の手順に従ってローカルマシン上でデータを起動して実行してください。

Vincent Grégoire ら、頭頸部原体放射線療法におけるリンパ節標的ボリュームの選択と描写。手術経験に基づく用語と手順の標準化への提案、放射線治療と腫瘍学、vol. 56、135-150ページ、2000年、土井：https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4。 ↩
Vincent Grégoire、A. Aisbruch、M. Hamoir、および P. Levendag、 「結節陽性および術後頸部における結節 CTV の描写に関する提案」 、 「放射線療法と腫瘍学」 、第 1 巻。 79、いいえ。 1、15-20 ページ、2006 年 4 月、土井: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009。 ↩
Vincent Grégoire et al.、頭頸部腫瘍の頸部リンパ節レベルの描写: 2013 年の最新情報。 DAHANCA、EORTC、HKNPCSG、NCIC CTG、NCRI、RTOG、TROG コンセンサスガイドライン、放射線療法と腫瘍学、vol. 110、いいえ。 1、172-181 ページ、2014 年 1 月、土井: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010。 ↩
Julian Biau et al.、根治的な頭頸部放射線療法のためのリンパ節ターゲットボリュームの選択: 2019 最新情報、放射線療法と腫瘍学、vol. 134、1-9 ページ、2019 年 5 月、土井: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018。 ↩
ジャティン。 P. Shah、FC Candela、AK Poddar、口腔扁平上皮癌からの頸部リンパ節転移のパターン、 Cancer 、vol. 66、いいえ。 1、109-113 ページ、1990 年、土井: https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A。 ↩
Laurence Bauwens et al.、 HPV 陽性および HPV 陰性の中咽頭扁平上皮癌における頸部リンパ節転移の有病率と分布、放射線療法と腫瘍学、vol. 157、122-129ページ、2021年4月、土井：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028。 ↩
Bertrand Pouymayou、P. Balermpas、O. Riesterer、M. Guckenberger、および J. Unkelbach、頭頸部癌における個人化された選択的 CTV 定義のためのリンパ腫瘍進行のベイジアンネットワークモデル、医学と生物学の物理学、vol. 64、いいえ。 16、p. 165003、2019 年 8 月、土井: https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18。 ↩ ↩ ²
Roman Ludwig、B. Pouymayou、P. Balermpas、および J. Unkelbach、 「頭頸部のリンパ性腫瘍進行の隠れマルコフモデル」 、 Sci Rep 、vol. 11、いいえ。 1、p. 12261、2021 年 12 月、土井: https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1。 ↩ ↩ ²
Roman Ludwig et al.、オンラインインターフェイスによる中咽頭扁平上皮癌におけるリンパ節関与の詳細な患者個人報告、放射線療法と腫瘍学、2022 年 2 月、doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035。 ↩
ローマン・ルートヴィヒ、J.-M. Hoffmann、B. Pouymayou et al.、オンラインインターフェースを使用した中咽頭扁平上皮癌におけるリンパ節関与の詳細な患者個人報告、 medRxiv 、2021 年 12 月。doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001。 ↩