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その他のソースコード

v4.2.4

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SIAR v4.2.4.XXXX

R での安定同位体分析 - パッケージ

このパッケージは使用しないでください。

重要: SIAR は現在消滅しています (死んだ、なくなった、終わった)。
- 楕円と凸包のフィッティングには SIBER パッケージを使用してください。
- 混合モデルのフィッティングには、MixSIAR パッケージを使用してください。このパッケージは、他の新しい開発の中でも線形共変量と階層的変量効果を含めるための最新のオプションスイートを提供します。パッケージ simmr を使用して、混合モデルの簡易バージョンまたは軽量バージョンをフィッティングすることもできます。

Parnell, AC、Inger R.、Bearhop, S. & Jackson, AL、2010 年。安定同位体を使用したソース分割: 変動が多すぎる場合の対処。 PLoS ONE、5(3)、e9672 。土肥

バージョン 4.2.4.XXXXX

SIARは現在廃止されています。
- 楕円と凸包のフィッティングには SIBER パッケージを使用してください。
- 混合モデルのフィッティングには、MixSIAR パッケージを使用してください。このパッケージは、他の新しい開発の中でも線形共変量と階層的変量効果を含めるための最新のオプションスイートを提供します。パッケージ simmr を使用して、混合モデルの簡易バージョンまたは軽量バージョンをフィッティングすることもできます。

バージョン4.2.4

「siarplotdatawrapper」関数と「siarplotdata」関数に「color.src」引数（デフォルトとして20の異なる色が設定されている）を追加し、ユーザーはソース項目の色を自分で設定できます。
「siarhdrs」関数の出力を c("Low 95% hdr","High 95% hdr","mode","mean") から c("Mean", "SD", "2.5%", " に変更しました) 5%"、"25%"、"50%"、"75%"、"95%"、"97.5%") がデフォルトとして設定されます。
add 「siarhdrs」関数の戻り値。

バージョン 4.2.3 2018 年 2 月 20 日

4.2.2.9000 のバグが組み込まれています。
siarproportionbysourceplotおよびsiarproportionbygroupplotによって出力される信頼区間のラベル付けに関するバグが修正されました。

バージョン 4.2.2.9000 ホットフィックス 2017 年 3 月 28 日

spatstatが壊れた siar パッケージに更新しました。これは、master ブランチのホットフィックスでspatstat.utilsに置き換えられます。

バージョン 4.2.2 の修正:

データフレームが自動的に二重形式に強制されないために発生する、コンシューマデータの単一グループに対する .C() の呼び出しのバグ。強制は as.double(as.matrix(some.data)) になりました。これにより、メッセージerror: not a matrix

バージョン 4.2.1 の修正:

https://github.com/lsaravia で発見された、siar:bayesMVN 経由の Bayesm:rmultireg への呼び出しに関する Linux ディストリビューションの SIBER ルーチンのバグ
siardensityplot() の main="myweawesomegraph" 引数が機能するようになりました。
すべての *.Rd ファイルの線幅が PDF 作成の 90 文字制限内に収まるようになりました。
どのような場合にも使用されないquartz()呼び出しのいくつかのインスタンスをクリーンアップしました。

SIARのインストール

devtools パッケージがインストールされている場合は、GitHub から直接インストールできます。しかし、本当にそうすべきではありません。このパッケージはサポートも推奨もされていません。

	library( devtools )
	install_github( " andrewljackson/siar@master " , build_vingettes = TRUE )
	library( siar )

チュートリアル、ヘルプ、支援

http://www.tcd.ie/Zoology/research/groups/jackson/projects/siar から、サンプルファイル、ビデオポッドキャスト、チュートリアルなどへのリンクを含む、SIAR の使用を開始するために利用できるさまざまな資料が用意されています。 php. https://github.com/AndrewLJackson/SIAR-examples-and-queries にはさらに多くのファイルとサンプルがあり、将来のある時点でこれらのさまざまなファイルをこの git リポジトリおよび/または付随する git Web サイトに統合する予定です。また、現在 SIBER のメジャーアップデートに取り組んでおり、ある時点で SIAR パッケージから削除される予定です https://github.com/AndrewLJackson/SIBER-sandbox。