conStruct

コンストラクト（連続構造）readme

このレポは、メソッドコンストラクトのコード - 連続および離散集団の遺伝構造をモデル化するための統計ツールを含んでいます。

出版物に関連付けられた原稿、データファイル、および分析スクリプト「空間全体の連続的および個別の集団遺伝構造を推測する」は、以下のリンクでアクセスできます。

• 紙
• 原稿リポジトリ
• データドライアド

インストール

最新リリース

コンストラクトRパッケージの最新リリースをインストールするには：

install.packages( " conStruct " )

インストールすると、コンストラクトモデルがコンパイルされ、画面に多くのテキスト、場合によっては警告を吐き出す可能性があります。これは完全に正常であり、エラーが発生し、インストールが失敗した場合にのみ心配する必要があります。

開発バージョン

GitHubから開発バージョンをインストールするには：

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Windowsユーザーは、 construct Rパッケージをインストールしようとする前に、rtoolsをスタンドアロン実行可能ファイルとしてダウンロードする必要がある場合があることに注意してください。

はじめる

すべての文書化された関数の完全なマニュアルはこちらから入手できます。

さらに、パッケージには、分析パイプラインのさまざまなステップを詳細に説明する4つのビネットが含まれています。あなたはそれらを使用して見つけることができます：

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

パッケージに含まれるデータファイルの例もあります。コマンドを使用してロードできます。

	data( conStruct.data )

接触

マニュアルとビネットを参照した後、すべてのクエリをbradburd（at）umich.eduに指示するか、gitリポジトリの問題として投稿してください。