tIGAr

ティガー

フェニックスを使用した等尺性分析（IGA）のためのPythonライブラリ。次の記事では、Tigarのデザインの概要を説明しています。

 @article{Kamensky2019,
title = "{tIGAr}: Automating isogeometric analysis with {FEniCS}",
journal = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
volume = "344",
pages = "477--498",
year = "2019",
issn = "0045-7825",
doi = "https://doi.org/10.1016/j.cma.2018.10.002",
author = "D. Kamensky and Y. Bazilevs"
}

依存関係

• 意味のある使用には、フェニックス（バージョン2019.2）とその依存関係が必要です。
• Scipyが必要です。 （ScipyはすでにFenics Docker Distributionsに含まれています。）
• NURBSモジュールの使用には、Igakitが必要です。
• APIドキュメントをコンパイルするには、Sphinxが必要です。
• 結果を視覚化するための最も便利なプログラムは、パラビューです。

インストール

すべての依存関係をインストールし、リポジトリをクローン（またはアーカイブからダウンロードして抽出）し、リポジトリのトップレベルディレクトリ（すなわち、サブディレクトリのtIGAr 、 docsなどを持つもの）を環境変数PYTHONPATHに追加します。追加

 export PYTHONPATH=/path/to/repository/: $PYTHONPATH

~/.bashrcファイル（およびsource - ）に。 （オプションで）APIドキュメントを作成し、ディレクトリをdocsに変更し、 make html 。メインドキュメントは、 ./_build/html/index.htmlになり、Webブラウザーで開くことができます。

クラスター上

HPCクラスターでフェニックス（したがってティガー）を使用する最も便利な方法は、特異点を介してです。 Tigarを使用するための特異点レシピは、ファイルsingularity-recipe.defにあります。そのファイルのコメントには、いくつかの追加メモが提供されています。

一般的なインストールの問題

• petsc4py.PETSc.Mat object has no attribute PtAP ：これはpetsc4pyの古いバージョンによるものです。 pip3経由で最新バージョンをインストールしてみてください。
• ImportError: No module named dolfin ：これはpython3ではなくpython使用しようとするときに発生します。 Fenics 2018.1以降はPython 2をサポートしなくなりました。
• Python.h: No such file or directory ：これには、Python C APIのヘッダーファイルをインストールする必要があります。 ubuntuでは、これらはsudo apt-get install python3-devを介してインストールできます。
• ModuleNotFoundError: No module named 'scipy._lib.decorator' ：scipy pip3 install --force-reinstall scipyてみてください。
• フェニックスの古いバージョンによるエラー：ターミナルでdolfin-version実行して、フェニックスのバージョンを確認します。特に、現在の安定したバージョンのフェニックスのUbuntu PPAは、最新の数匹のUbuntuリリースでのみ維持されていることに注意してください。古いUbuntuリリースにパッケージマネージャーを介してインストールすると、古いバージョンのFenicsがインストールされる場合があります。
• libgfortran.so.3 cannot be found 。または、特異性コンテナを使用する場合、 libgfortranのその他の問題：ファイルsingularity-recipe.defの%postセクションの下にapt-get -y install libgfortran3ください。