ViMO

vimo

Meta-OMICS（VIMO）のVisualizerは、メタゲノミクス、メタトランスクリプトミクス、メタプロテオミクス間のデータ統合を促進するインタラクティブなR-Shinyベースのアプリケーションです。同時に、Vimoは、データのインタラクティブで出版対応の、関連するグラフィカルな表現をユーザーに提供することを目指しています。

VIMOはここからオンラインでアクセスできます：
https://magnusarntzen.shinyapps.io/visualizerformetaomics/

VIMOはデータを統合します

• メタゲノミクス
• Metatranscriptomics
• メタプロテオミクス
• 分類
• 品質対策
• KEGG機能とモジュールの完了
• 炭水化物活性酵素（カザイム）

Vimoは次の区画を作成します

• 雑誌の品質
• さまざまなファイルの豊富さ
• さまざまな雑誌のカザイムカテゴリーと、転写産物レベルとタンパク質レベルでのそれらの豊かさ
• さまざまな雑誌のkeggカテゴリと、転写産物およびタンパク質レベルでのそれらの豊かさ
• keggモジュールの完了分数各マグの代謝の可能性を確認する

いくつかの例出力：

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