iPhone 6 は iOS 8 システムを実行しますが、Apple 6s は iOS 9 システムを搭載しています。 iOS 8 と比較して、iOS 9 はパフォーマンスの最適化、セキュリティの向上、新機能の点で向上しています。たとえば、iOS 9 では、スポットライト検索の強化、ニュース アプリケーション、低電力モードなどの新機能が導入されています。
Apple 6sではA9チップを採用しているため、Apple 6のA8チップに比べて処理速度が大幅に向上しており、大規模なアプリケーションやゲームの実行がよりスムーズになります。同時に、Apple 6s は 3D タッチ機能などのより最新のアプリケーション機能をサポートし、よりインタラクティブな方法と素早い操作オプションをユーザーに提供します。
iPhone 6 と iPhone 6s の背面カメラはどちらも 1,200 万ピクセルですが、Apple 6s はビデオ録画品質、低照度環境でのパフォーマンス、画像処理アルゴリズムの点でアップグレードされています。 iPhone 6s は 4k ビデオ録画をサポートしていますが、iPhone 6 は 1080p HD ビデオに限定されています。さらに、Apple 6s の Live Photos 機能も写真の楽しさとインタラクティブ性を高めます。
Apple 6s はハードウェアの点ではアップグレードされていますが、より強力なプロセッサと高解像度の画面により、バッテリー容量は大幅に増加していません。したがって、日常的な使用では、Apple 6s のバッテリー寿命は Apple 6 よりもわずかに劣る可能性があります。ただし、Apple 6s は高速充電テクノロジーをサポートしているため、充電の待ち時間を短縮できます。
Apple 6sでは、Touch IDの指紋認証機能が追加される（デバイスにこの機能が搭載されている場合）など、セキュリティ面も強化されている。 Apple 6 は Touch ID もサポートしていますが、いくつかの新しいセキュリティ機能と暗号化テクノロジーの点では、Apple 6s には特定の利点があります。
