scMulan
1.0.0
scMulan_v1 저장소에 오신 것을 환영합니다. 곧 출시될 작업인 "scMulan: 단일 세포 분석을 위한 다중 작업 생성 사전 훈련된 언어 모델"을 소개합니다.
scMulan은 단일 세포 전사체학 분석을 위한 획기적인 기반 모델입니다.
특징:
conda create -n scMulan python==3.10
conda activate scMulan
pip install -r requirements.txt
ckpt 파일을 다운로드하여 ./ckpt/ 아래에 넣으세요.
테스트 adata 파일을 준비하고 scMulan 사용을 시작하세요.
우리는 세포 유형 주석을 위해 scMulan을 사용하는 튜토리얼을 제공했습니다(튜토리얼 참조). 현재 scMulan은 심장, 폐, 간, 골수, 혈액, 뇌 및 흉선을 포함한 7개 기관의 인간 세포 유형에 대한 제로 샷 주석을 지원합니다.
일괄 통합을 위한 셀 임베딩을 얻는 데에도 사용할 수 있습니다(튜토리얼 참조). 쉽게 adata를 사용하고 scMulan에서 분석을 받을 수 있습니다.
scMulan은 이제 npu에 대한 추론을 지원합니다.
