Kit RDK
O que é?
O RDKit é uma coleção de software de química e aprendizado de máquina escrito em C++ e Python.
- Licença BSD - uma licença comercial para código aberto
- Principais estruturas de dados e algoritmos em C++
- Wrapper Python 3.x gerado usando Boost.Python
- Wrappers Java e C# gerados com SWIG
- JavaScript (gerado com emscripten) e wrappers CFFI em torno de funcionalidades importantes
- Operações moleculares 2D e 3D
- Geração de descritor e impressão digital para aprendizado de máquina
- Cartucho de banco de dados molecular para PostgreSQL com suporte para pesquisas de subestrutura e similaridade, bem como muitas calculadoras de descritores
- Nós de quimioinformática para KNIME
- Pasta Contrib com software útil contribuído pela comunidade aproveitando o poder do RDKit
Instalação e primeiros passos
Se você estiver trabalhando em Python e usando conda (nossa recomendação), a instalação é super fácil:
$ conda install -c conda-forge rdkit
Você pode então dar uma olhada em nosso guia Primeiros passos em Python.
Instruções de instalação mais detalhadas estão disponíveis em Docs/Book/Install.md.
Documentação
Disponível na página do RDKit e na pasta Docs no GitHub
O blog do RDKit geralmente traz dicas e truques úteis.
Apoio e Comunidade
Se você tiver dúvidas, comentários ou sugestões, os melhores lugares para isso são:
- Discussões do GitHub
- A lista de discussão
Se você encontrou um bug ou gostaria de solicitar um recurso, crie um problema
Também temos um grupo no LinkedIn
Temos uma reunião anual de grupos de usuários (UGM), onde membros da comunidade fazem apresentações e palestras relâmpago sobre coisas que fizeram com o RDKit. Materiais de UGMs anteriores, que podem ser bastante úteis, também estão online:
- 2012 UGM, Londres
- 2013 UGM, Hinxton
- 2014 UGM, Darmstadt
- 2015 UGM, Zurique
- 2016 UGM, Basileia
- 2017 UGM, Berlim
- 2018 UGM, Cambridge
- 2019 UGM, Hamburgo
- UGM 2020, virtual
- UGM 2021, virtual
- 2022 UGM, Berlim
- 2023 UGM, Mainz
- 2024 UGM, Zurique
Licença
Código lançado sob a licença BSD.