baixar sda

Aviso de arquivo

️ Este repositório não é mais mantido. O código foi integrado e desenvolvido em: https://github.com/neicnordic/sensitive-data-archive

Baixar SDA

sda-download é uma implementação go da API Data Out. A Referência da API contém exemplos de solicitações e respostas.

Implantação

O método de provisionamento recomendado para produção é:

• em um kubernetes cluster usando o gráfico do Helm;

Para desenvolvimento/teste local, consulte as instruções na pasta dev_utils. Há um arquivo README na pasta dev_utils com seções para executar o pipeline localmente usando Docker Compose.

• Primeira corrida
• Produção como corrida
• Execução manual

Componentes de API

Componente	Papel
intermediário	Executa verificação e validação de token de acesso
sda	Constrói os principais endpoints de API para a API NeIC SDA Data Out.

Componentes Internos

Componente	Papel
configuração	Pacote para gerenciar configuração.
banco de dados	Fornece funcionalidades para utilização do banco de dados, bem como funções de alto nível para trabalhar com o SDA-DB.
armazenar	Fornece interface para áreas de armazenamento, como um sistema de arquivos regular (POSIX) ou um armazenamento de objetos S3.
sessão	DatasetCache armazena as permissões e informações do conjunto de dados, independentemente de essas informações já terem sido verificadas ou não. Essas informações podem então ser usadas para ignorar o middleware de autenticação demorado

Componentes do pacote

Componente	Papel
autenticação	Auth pkg é usado pelo middleware para analisar detalhes do OIDC e extrair vistos GA4GH de um passaporte GA4GH
solicitar	Este pacote armazena um cliente HTTP, para que não precise ser inicializado a cada solicitação.