scib reproducibility

Reprodutibilidade scIB

Este repositório contém código suplementar para reproduzir as análises apresentadas no artigo de benchmarking de integração de célula única. Para outras partes do projeto scIB, consulte estes repositórios:

• pacote scIB
• pipeline scIB
• Dados usados ​​no estudo

Alguns resultados suplementares podem ser visualizados no site de resultados em https://theislab.github.io/scib-reproducibility.

Estrutura de diretório

• data/ - Arquivos de dados com resultados de benchmarking usados ​​para criar números e o site de resultados
• docs/ - O site de resultados renderizados
• notebooks/ - notebooks Jupyter usados ​​para preparar conjuntos de dados e métricas de avaliação
• scripts/ - Código de análise adicional
• visualization/ - Código para geração de figuras e visualizações
• website/ - Código para geração do site de resultados