lyprox
1.0.0
É um aplicativo da web Django que exibe os padrões detalhados de metástases linfáticas no câncer de cabeça e pescoço e permite explorar o (s) conjunto (s) de dados subjacente (s) com muitos detalhes. Ele está hospedado no URL https://lyprox.org.
O HNSCC se espalha pelo sistema linfático do pescoço e forma metástases nos gânglios linfáticos regionais. Metástases macroscópicas podem ser detectadas com modalidades de imagem como ressonância magnética, PET e tomografia computadorizada. Conseqüentemente, são incluídos no volume alvo, quando a radioterapia é escolhida como parte do tratamento. No entanto, as metástases microscópicas são muito pequenas para serem diagnosticadas com as técnicas de imagem atuais.
Para explicar esse envolvimento microscópico, partes do sistema linfático são frequentemente irradiadas eletivamente para aumentar o controle do tumor. Quais partes serão incluídas neste volume-alvo clínico eletivo são atualmente decididas com base em diretrizes 1 2 3 4 . Estes, por sua vez, são derivados de relatos da prevalência de envolvimento por nível de linfonodo (LNL), ou seja, a parcela de pacientes que foram diagnosticados com metástases em qualquer LNL, estratificados pela localização do tumor primário. Recomenda-se incluir um LNL no volume alvo eletivo se 10-15% dos pacientes apresentarem envolvimento nesse nível específico.
No entanto, embora a prevalência do envolvimento tenha sido relatada na literatura 5 6 e as vias gerais de drenagem linfática sejam bem compreendidas, os padrões detalhados de progressão do CECP permanecem pouco quantificados. Acreditamos que o risco de envolvimento microscópico num LNL depende muito do diagnóstico específico de um determinado paciente e o seu tratamento pode, portanto, ser personalizado se os padrões de progressão forem melhor quantificados.
Com a interface, pretendemos principalmente tornar nosso conjunto de dados extraído facilmente acessível. Ao visualizá-lo de forma interativa, pode-se testar ou levantar hipóteses muito rapidamente sobre a disseminação linfática do CECP. Esperançosamente, isto, por sua vez, motiva outros investigadores a investigar estas hipóteses, extrair e partilhar mais dados com detalhes semelhantes.
Isso, por sua vez, nos permitiria (ou a qualquer pessoa, na verdade) construir modelos de progressão tumoral mais precisos e precisos. Por exemplo, como trabalhos anteriores sobre a utilização de redes bayesianas para prever a probabilidade personalizada de envolvimento 7 ou a nossa recente publicação sobre esta questão utilizando modelos ocultos de Markov e introduzindo assim uma forma explícita de modelar o tempo 8 .
Os dados visualizados nesta interface residem em um repositório de código aberto próprio: lyDATA.
Também publicamos um artigo sobre o conjunto de dados e a interface em Radiotherapy & Oncology 9 , com uma pré-impressão disponível em medRxiv 10 .
Também trabalhamos em modelos probabilísticos 7 8 que podem prever a propagação linfática do cancro da cabeça e pescoço. O código subjacente está hospedado em outro repositório: linfa.
Existem duas maneiras de contribuir para este projeto:
Se você quiser hospedar seus dados sozinho ou testar a aparência deles no aplicativo da web sem se comprometer com um upload, sinta-se à vontade para seguir estas instruções para colocá-los em funcionamento em sua máquina local.
Vincent Grégoire e outros, Seleção e delineamento de volumes alvo de linfonodos em radioterapia conformada de cabeça e pescoço. Proposta de padronização de terminologia e procedimento com base na experiência cirúrgica , Radioterapia e Oncologia , vol. 56, pp. ↩
Vincent Grégoire, A. Eisbruch, M. Hamoir e P. Levendag, Proposta para o delineamento do CTV nodal no nódulo positivo e no pescoço pós-operatório , Radioterapia e Oncologia , vol. 79, não. 1, pp. 15-20, abril de 2006, doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009. ↩
Vincent Grégoire et al., Delineamento dos níveis dos nódulos cervicais para tumores de cabeça e pescoço: uma atualização de 2013. DAHANCA, EORTC, HKNPCSG, NCIC CTG, NCRI, RTOG, diretrizes de consenso TROG , Radioterapia e Oncologia , vol. 110, não. 1, pp. 172-181, janeiro de 2014, doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010. ↩
Julian Biau et al., Seleção de volumes alvo de linfonodos para radioterapia definitiva de cabeça e pescoço: uma atualização de 2019 , Radioterapia e Oncologia , vol. 134, pp. 1-9, maio de 2019, doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018. ↩
Jatina. P. Shah, FC Candela e AK Poddar, Os padrões de metástases em linfonodos cervicais de carcinoma escamoso da cavidade oral , Câncer , vol. 66, não. 1, pp. ↩
Laurence Bauwens et al., Prevalência e distribuição de metástases em linfonodos cervicais em carcinoma espinocelular orofaríngeo HPV-positivo e HPV-negativo , Radiotherapy and Oncology , vol. 157, pp. 122-129, abril de 2021, doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028. ↩
Bertrand Pouymayou, P. Balermpas, O. Riesterer, M. Guckenberger e J. Unkelbach, Um modelo de rede bayesiana de progressão de tumor linfático para definição eletiva personalizada de CTV em câncer de cabeça e pescoço , Physics in Medicine & Biology , vol. 64, não. 16, pág. 165003, agosto de 2019, doi: https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18. ↩ ↩ 2
Roman Ludwig, B. Pouymayou, P. Balermpas e J. Unkelbach, Um modelo oculto de Markov para progressão de tumor linfático na cabeça e pescoço , Sci Rep , vol. 11, não. 1, pág. 12261, dezembro de 2021, doi: https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1. ↩ ↩ 2
Roman Ludwig et al., Relato detalhado paciente-individual do envolvimento de linfonodos no carcinoma espinocelular de orofaringe com uma interface online , Radioterapia e Oncologia , fevereiro de 2022, doi: https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 0,035. ↩
Roman Ludwig, J.-M. Hoffmann, B. Pouymayou et al., Relatório detalhado paciente-individual sobre envolvimento de linfonodos no carcinoma espinocelular de orofaringe com interface online , medRxiv , dezembro de 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.01.21267001. ↩
