conStruct

construto (estrutura contínua) Readme

Este repositório contém o código para a construção do método - uma ferramenta estatística para modelar estrutura genética populacional contínua e discreta.

O manuscrito, os arquivos de dados e os scripts de análise associados à publicação "inferir a estrutura genética da população contínua e discreta no espaço" foram movidos e podem ser acessados ​​nos links abaixo:

• papel
• repo manuscrito
• dryad de dados

Instalação

Última lançamento

Para instalar o lançamento mais recente do pacote Construct R:

install.packages( " conStruct " )

Após a instalação, os modelos de construção serão compilados, o que pode cuspir muito texto e, possivelmente, alguns avisos na tela. Isso é totalmente normal e você só deve se preocupar se receber erros e a instalação falhar.

Versão de desenvolvimento

Para instalar a versão de desenvolvimento do GitHub:

	library( devtools )
	install_github( " gbradburd/conStruct " , build_vignettes = TRUE )

Observe que os usuários do Windows podem ter que baixar o Rtools como um executável independente antes de tentar instalar o pacote de construção r.

Começando

Um manual completo para todas as funções documentadas está disponível aqui.

Além disso, existem quatro vinhetas incluídas no pacote que passam por várias etapas no pipeline de análise em detalhes. Você pode encontrá -los usando:

 # formatting data
	vignette( topic = " format-data " , package = " conStruct " )

# how to run a conStruct analysis
	vignette( topic = " run-conStruct " , package = " conStruct " )

# how to visualize the output of a conStruct model
	vignette( topic = " visualize-results " , package = " conStruct " )

# how to compare and select between different conStruct models
	vignette( topic = " model-comparison " , package = " conStruct " )

Há também um exemplo de arquivo de dados incluído no pacote, que você pode carregar usando o comando:

	data( conStruct.data )

Contato

Depois de se referir ao manual e às vinhetas, direcione todas as consultas para Bradburd (em) Umich.edu ou poste como problemas no repositório do Git.