dimple

ondulação

Oleoduto de cristalografia macromolecular para refinamento e triagem de ligantes.

Veja documentos em http://ccp4.github.io/dimple

Instalação

Dimple faz parte da suíte CCP4. Todo o trabalho é realizado por outros programas da suíte, que são executados por baixo. Mais importante ainda, refmac e phaser . Então você precisa ter o CCP4 instalado.

Para testar a versão mais recente de desenvolvimento, clone este repositório e execute ./dimple/dimple .

O Dimple vem com um pequeno utilitário find-blobs . Se você não compilar, a versão da suíte CCP4 será usada. A compilação requer biblioteca Clipper, que, por sua vez, requer MMDB2 e LIBCCP4. Você pode criar tudo, desde a fonte ou usar o CONDA para baixar binários compilados com o GCC 4.8. Este último pode ser feito instalando Miniconda e fazendo:

 conda install -c mw clipper

Do que construir Blobs apontando onde estão as bibliotecas necessárias:

 export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98"  # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make

Não há necessidade de fazer instalar - o binário aterrissou no mesmo diretório que os scripts e a Dimple do Python usará programas daqui, preferencial para os de $CCP4/bin .

Se não funcionar - veja os métodos de contato abaixo.

Comentários?

Quaisquer pensamentos, comentários ou feedback são bem -vindos. Se não funcionar como esperado ou não funcionar - informe -nos o mais rápido possível. Use o rastreador de problemas ou envie um email para CCP4 helpdesk ou envie um email para [email protected] ou.

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Feito na fonte de luz de diamante e no CCP4-Harwell.