APPIAN
1.0.0
Introdução
Instalação
Documentação
3.1 Guia do usuário
3.2 Guia do desenvolvedor
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Termos e Condições
O pipeline Appian é implementado no Python usando a biblioteca Nipype. Embora o núcleo do código seja escrito no Python, o pipeline pode usar ferramentas ou incorporar módulos gravados em qualquer linguagem de programação. A única condição é que as ferramentas devem ser capazes de ser executadas a partir de uma linha de comando com entradas e saídas bem definidos. Nesse sentido, Appian é agnóstico da linguagem.
Appian é 100% gratuito e de código aberto, mas em troca apreciaríamos muito o seu feedback, seja como relatórios de bugs, puxar solicitações para adicionar novos recursos, perguntas em nossa lista de discussão ou sugestões sobre como melhorar a documentação ou a código. Você pode até nos enviar um e -mail para nos informar em que tipo de projeto você está trabalhando!
APPIAN está atualmente disponível apenas no Docker. O Docker é uma plataforma para criar contêineres que embalam um determinado software em um sistema de arquivos completo que contém tudo o que precisa ser executado e garante que o software sempre possa ser executado no mesmo ambiente. Isso significa que todas as dependências exigidas pelo APPIAN estão dentro de seu contêiner do Docker (não há necessidade de tentar compilar bibliotecas obscuras). No entanto, isso também significa que você precisará instalar singularidade ou docker antes de prosseguir. Não se preocupe, é muito fácil (exceto talvez para o Windows). Para um guia sobre como instalar o Docker no Ubuntu, Debian, Mac, Windows ou outro sistema operacional, visite este link a.
O pipeline é implementado no Python usando a biblioteca do Nipype. Embora o núcleo seja codificado em Python, o pipeline pode usar ferramentas ou incorporar módulos gravados em qualquer linguagem de programação. A única condição é que essas ferramentas devem ser executadas a partir de uma linha de comando, com entradas e saídas bem definidos. Nesse sentido, APPIAN é agnóstico da linguagem. Quando o Docker ou a Singularidade for instalada, basta executar a seguinte linha de comando em seu terminal:
docker pull tffunck/appian:latest
É isso, APPIAN está instalado no seu computador.
Para aqueles interessados em estender ou contribuir para o Appian, consulte nosso Guia do desenvolvedor.
Para mais informações, leia nosso guia do usuário.
Para aqueles interessados em estender ou contribuir para o Appian, consulte as diretrizes de nossas contribuidores.
Funck T, Larcher K, Toussaint PJ, Evans AC, Thiel A (2018) Appian: Pipeline automatizado para análise de imagem para animais de estimação. Neuroinforma frontal . PMCID: PMC6178989, doi: 10.3389/fninf.2018.00064
Appian automatizou o CQ ( em preparação )
Se você ficar preso ou não sabe como começar, envie um e-mail para [email protected]:
Thomas Funck, candidato a doutorado ([email protected])
Kevin Larcher, MSC Eng.
Paule-Joanne Toussaint, PhD
Copyright 2017 Thomas Funck, Kevin Larcher
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