kraken2
v2.1.3
A segunda versão do sistema de classificação de sequência taxonômica Kraken
Consulte o manual de operação (em docs/MANUAL.html
) para obter detalhes sobre como usar o Kraken 2.
Para detalhes adicionais da implementação e orientação sobre o uso do Kraken 2, você também pode consultar:
O artigo descrevendo a primeira versão de Kraken. Observe que Kraken 2 é uma reescrita do Kraken 1 e não é compatível com Kraken 1.
O artigo que descreve Krakenuniq. A funcionalidade baseada em HLL da KrakenuniQ é incorporada no Kraken 2 ao usar a bandeira --report-minimizer-data
descrita no manual de operação.
O papel Kraken 2.
Um artigo de protocolo que descreve o uso do Kraken 2.