ViMO

Vimo

O Visualizer for Meta-Oômica (VIMO) é um aplicativo interativo baseado em R-Shiny para facilitar a integração de dados entre metagenômica, metanscriptômica e metaproteômica. Ao mesmo tempo, o Vimo pretende fornecer ao usuário representações gráficas interativas, prontas para publicação e relevantes dos dados.

O VIMO pode ser acessado online aqui:
https://magnusarntzen.shinyapps.io/visualizerformetaomics/

VIMO integrar dados de

• Metagenômica
• Metatranscriptomics
• Metaproteômica
• Taxonomia
• Medidas de qualidade
• Funções Kegg e conclusão do módulo
• Enzimas ativas de carboidratos (cazimas)

Vimo faz lotes de:

• Qualidade da revista
• Abundância de mag em vários arquivos
• Categorias de cazimas em várias revistas e suas abundâncias no nível de transcrição e proteína
• Categorias KEGG em várias revistas e suas abundâncias no nível de transcrição e proteína
• Frações de conclusão do módulo KEGG para ver o potencial metabólico de cada mag

Algum exemplo de saída:

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