mcera5

Пакет для загрузки и обработки данных ERA5, готовый к использованию при моделировании микроклимата. Соответствующая статья с описанием пакета находится здесь, в «Методах экологии и эволюции» .

Установить

Вы можете установить пакет из этого репозитория GitHub с помощью следующей строки:
remotes::install_github("dklinges9/mcera5")

Новости

8 октября 2024 г .: в mcera5 реализована модульность для обработки файлов повторного анализа ERA5 и файлов ERA5-land, загруженных как из старого (устаревшего) CDS, так и из нового (бета-версии) CDS. Кроме того, пользователи должны указать, хотят ли они, чтобы извлеченные климатические данные были отформатированы для конкретного пакета микроклимата R: microclima , NicheMapR , microclimc , microclimf или micropoint ( microclimc используется по умолчанию). Ветка «new_cds_time_edits» объединена с основной и скоро будет удалена.

25 сентября 2024 г .: Файлы ERA5-реанализа и ERA5-land, загруженные из бета-версии CDS, имеют структуру, отличную от временного измерения. Чтобы извлечь климатические данные из этих файлов (например, с помощью extract_clim() ), обратитесь к ветке разработчика «new_cds_time_edits». Вы можете установить эту ветку напрямую через:

remotes::install_github("dklinges9/mcera5", ref = "new_cds_time_edits")

Сентябрь 2024 г .: Этот пакет находится в стадии тщательной разработки, чтобы не отставать от изменений, связанных с переходом ECMWF на новое бета-хранилище климатических данных. Эти изменения включают более низкие ограничения API, другие имена переменных/файловые структуры netCDF и другие учетные данные (подробности см. ниже). Если вы столкнулись с необъяснимыми ошибками, обратите на них мое внимание (см. «Вопросы, проблемы, проблемы» ниже).

Учебное пособие

Доступ к виньетке можно получить через:
vignette("mcera5_vignette")

Альтернативно вы можете перейти к виньетке вручную здесь, в репозитории GitHub.

Настраивать

Климатические данные ERA5 можно загрузить из хранилища климатических данных ЕЦСПП (CDS). Обратите внимание, что в июле 2024 года CDS перешел на новую платформу, а старая платформа была объявлена устаревшей в сентябре 2024 года. Ниже описывается, как получить доступ к данным с помощью R:

Зарегистрируйте учетную запись ЕЦСПП здесь. При регистрации вам необходимо будет принять все Положения и условия, перечисленные в нижней части формы.
Затем перейдите на сайт CDS здесь и войдите в систему, используя кнопку в правом верхнем углу. После входа в систему наведите указатель мыши на свое имя в правом верхнем углу и нажмите появившуюся опцию «Ваш профиль» (это должно привести вас на эту страницу. Здесь вы найдете свой идентификатор пользователя (UID) и токен личного доступа, оба они необходимы для удаленной загрузки данных из CDS. Запишите их.
Каждый набор данных CDS имеет свои уникальные Условия использования. Вам необходимо будет принять настоящие Условия для повторного анализа ERA5 на этой странице (прокрутите вниз до «Условий использования» и примите). Тот же набор условий применяется и к другим продуктам Copernicus, включая ERA5-land.

Вопросы, опасения, проблемы

Прежде чем отправлять сообщение о проблеме по электронной почте, отправьте воспроизводимый пример как проблему в этом репозитории Github. Для этого перейдите на главную страницу этого репозитория и нажмите вкладку «Проблемы», а затем «Новая проблема». Если у вас нет учетной записи GitHub или вы по какой-либо причине не можете сообщить о проблеме, свяжитесь с Дэвидом Клингесом по адресу [email protected].