опал

Опал

Opal — это основное приложение базы данных OBiBa для биобанков или эпидемиологических исследований.

• См. инструкции по загрузке.
• Прочтите документацию.
• Есть ошибка или вопрос? Пожалуйста, создайте проблему на GitHub.
• Непрерывная интеграция реализована в Travis.

Разработчики

Настраиваем среду разработки:

• Убедитесь, что Java8 доступен.
• Убедитесь, что у вас работает база данных MongoDB, MySQL или MariaDB.
• Скомпилировать с помощью make all
• Получите репозиторий obiba-home, чтобы иметь некоторый исходный материал.
• Подготовьте среду выполнения: make prepare (сделайте это только один раз, при этом будет создан каталог opal_home)
• Запустить в режиме отладки: make debug
• Войдите http://localhost:8080 с учетными данными администратора и паролем.
• Объявить базы данных (только при первом подключении)
• Зайдите в проект obiba-home и make seed-opal

Есть много других целей, просто проверьте Makefile и измените переменные в соответствии с вашей средой.

Список рассылки

Есть вопросы? Спросите в нашем списке рассылки!

[email protected]

http://groups.google.com/group/obiba-users

Лицензия

Программное обеспечение OBiBa имеет открытый исходный код и доступно по лицензии GPL3. Программное обеспечение OBiBa предоставляется бесплатно.

Благодарности ОБиБа

Если вы используете программное обеспечение OBiBa, пожалуйста, цитируйте нашу работу в своем коде, на веб-сайтах, в публикациях или отчетах.

«Работа, представленная здесь, стала возможной с использованием пакета OBiBa (www.obiba.org), пакета программного обеспечения, разработанного Maelstrom Research (www.maelstrom-research.org) и Epigeny (www.epigeny.io)»