PyMOL4Win

PyMOL с открытым исходным кодом для Windows

PyMOL с открытым исходным кодом доступен бесплатно. Предварительно скомпилированный PyMOL с открытым исходным кодом доступен бесплатно у Кристофа Гольке с факультета биомедицинской инженерии Калифорнийского университета в Ирвайне.

Этот репозиторий предоставляет способ установки PyMOL v2.6 в Windows. При необходимости португальская версия этого руководства доступна здесь.

Загрузка и установка

Выполните следующие действия, чтобы установить PyMOL v2.6:

1. Установите последнюю версию Python (v3.12.x) для Windows отсюда.

Примечание . Убедитесь, что выбрана опция добавления переменных среды, или добавьте папку python.exe в системную PATH.

2. Установите необходимые пакеты Python

 python -m pip установить numpy
python -m pip установить pmw
python -m pip установить pyqt5

3. Загрузите предварительно скомпилированные файлы колеса PyMOL с открытым исходным кодом, совместимые с Python 3.12 и 64-разрядной версией Windows, по ссылкам ниже:

• pymol-пусковая установка

• пимол

Примечание . Вы можете проверить версию Python в anaconda, набрав python --version .

Если вы используете другую версию Python или 32-разрядную версию Windows, здесь есть другие предварительно скомпилированные версии.

Структура имени файла следующая:

 pymol‑2.6.0a0‑cp312‑cp312‑win_amd64.whl
           
            ___ для 64-битной Windows
            
             ____________ для Python 3.12.x
             
              ____________________ PyMOL версии 2.6.0a0

4. Установить файлы колес

В окне CMD (не PowerShell!) переключитесь в каталог загрузки ( C:UsersDownloads ):

 Загрузки компакт-дисков

Затем установите pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl набрав:

 python -m pip install --no-index --find-links="%CD%" pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl

Наконец, чтобы установить pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl , запустите:

 python -m pip install --upgrade --no-deps pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl

Примечание . Если на шаге 4 вы загрузили разные файлы, замените pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl и pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl загруженными файлами колеса.

5. Запустите PyMOL v2.6.

В окне CMD (не PowerShell!) запустите:

 где.exe пимол
пимол

Затем PyMOL v2.6 будет запущен и готов к работе.

6. (Необязательно) Создайте ярлык для PyMOL.

 где.exe пимол

Будет отображено местоположение pymol.exe . Перейдите к местоположению файла, щелкните правой кнопкой мыши PyMOL.exe и скопируйте его на рабочий стол.