D SCRIPT

D-СКРИПТ

D-SCRIPT — это метод глубокого обучения для прогнозирования физического взаимодействия между двумя белками, учитывая только их последовательности. Он хорошо обобщается на новые виды и устойчив к ограничениям размера обучающих данных. Его конструкция отражает интуитивное представление о том, что для физического взаимодействия двух белков необходимо, чтобы набор аминокислот каждого белка находился в контакте с другим. Промежуточные этапы D-SCRIPT напрямую реализуют эту интуицию, причем предпоследний этап D-SCRIPT представляет собой приблизительную оценку карты межбелковых контактов димера белка. Этот структурно мотивированный дизайн повышает интерпретируемость результатов и, поскольку структура более консервативна в эволюционном плане, чем последовательность, улучшает возможность обобщения между видами.

• D-SCRIPT описан в статье Сэма Следзиски, Рохита Сингха, Ленор Коуэн и Бонни Бергер «Предсказание межбелковых взаимодействий на основе последовательностей: структурно-распознаваемая интерпретируемая модель глубокого обучения».

• Домашняя страница

• Документация