Cromwell — это система управления рабочими процессами с открытым исходным кодом для биоинформатики. Лицензирование осуществляется по пункту 3 BSD.
У документации Cromwell есть специальный сайт.
Впервые в Кромвеле? Начните работу с учебниками.
Думаете о вкладе в пользу Кромвеля? Начните с прочтения нашего Руководства для участников.
У Cromwell есть растущая экосистема проектов, поддерживаемых сообществом, которые сделают ваш опыт еще лучше! Посетите нашу страницу «Экосистема», чтобы узнать больше.
Поговорите с нами:
Многие пользователи сегодня запускают свои рабочие процессы WDL в Terra, управляемой облачной биоинформатической платформе со встроенной поддержкой WDL, предоставляемой Cromwell. См. здесь краткое руководство.
Пользователи с особыми потребностями, желающие установить и поддерживать свои собственные экземпляры Cromwell, могут загрузить образ JAR или Docker. Команда разработчиков принимает воспроизводимые отчеты об ошибках от самоуправляемых экземпляров, но не может обеспечить прямую поддержку.
Серверные части Cromwell получают ресурсы для разработки, пропорциональные потребностям пользователей. Команда активно разрабатывает Google Cloud и Microsoft Azure (см. Cromwell on Azure). Обслуживание других бэкэндов осуществляется в основном сообществом.
Cromwell поддерживает язык рабочих процессов WDL. Cromwell версии 80 и выше больше не поддерживает CWL.
CWL будет повторно представлен позднее на платформе Terra с использованием решения, отличного от Cromwell. Подробности см. в сообщении блога «Дорожная карта Terra по поддержке большего количества языков рабочего процесса».
Если вы считаете, что обнаружили проблему безопасности, свяжитесь с нами по [email protected]
.
Хотите сообщить о проблеме? Перейдите в раздел «Проблемы Github».
Если вы ранее сообщали о проблеме в JIRA, ссылка находится здесь. Новые регистрации больше не принимаются.