Описание

HOI (Higher Order Interactions) — это пакет Python, позволяющий выйти за рамки парных взаимодействий путем количественного определения статистических зависимостей между двумя или более единицами с использованием теоретико-информационных показателей. Пакет построен на основе Jax, позволяя выполнять вычисления на процессоре или графическом процессоре.

Установка

Зависимости

ХОИ требует:

Питон (>= 3,8)
число (> = 1,22)
острый (>=1,9)
Джакс
панды
scikit-learn
JAX-TQDM
tqdm

Пользовательская установка

Чтобы установить Jax на графический процессор или только на процессор, обратитесь к документации Jax: https://jax.readthedocs.io/en/latest/installation.html.

Если у вас уже есть работающая установка NumPy, SciPy и Jax, самый простой способ установить hoi — использовать pip :

pip install -U hoi

Вы также можете установить последнюю версию программного обеспечения прямо с Github:

pip install git+https://github.com/brainets/hoi.git

Для разработчиков

Разработчики могут установить его в режиме разработки с помощью следующих команд:

git clone https://github.com/brainets/hoi.git
cd hoi
pip install -e .[ ' full ' ]

Полная установка HOI включает дополнительные пакеты для тестирования программного обеспечения и сборки документации:

pytest
pytest-cov
кодеков
рентгеновский массив
сфинкс!=4.1.0
Сфинкс-галерея
pydata-сфинкс-тема
сфинксконтриб-бибтекс
numpydoc
матплотлиб
чешуйка8
pep8-именование
черный

Помощь и поддержка

Документация

Ссылка на документацию: https://brainets.github.io/hoi/
Обзор математической подготовки: https://brainets.github.io/hoi/theory.html.
Список реализованных метрик HOI: https://brainets.github.io/hoi/api/modules.html.
Примеры: https://brainets.github.io/hoi/auto_examples/index.html.